Perbezaan utama antara synteny dan collinearity ialah synteny ialah penyetempatan bersama fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam spesies, manakala collinearity ialah penyetempatan bersama fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam pemuliharaan spesies berbeza. pesanan yang sama.
Synteny dan kolineariti ialah dua istilah yang digunakan secara bergantian dalam genomik. Kedua-dua istilah menggambarkan corak penyetempatan gen pada kromosom dalam spesies yang berbeza. Susunan gen yang berkaitan di kalangan taksa ini adalah maklumat yang berharga apabila membuat kesimpulan tentang keturunan gen yang dikongsi. Synteny merujuk kepada penyetempatan bersama fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam spesies. Kolineariti merujuk kepada penyetempatan bersama fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama dalam spesies berbeza yang memelihara susunan yang sama. Oleh itu, ia adalah satu bentuk synteny.
Apakah Synteny?
Dalam spesies yang berbeza, terdapat satu set gen yang terletak pada kromosom yang sama. Dan, penyetempatan bersama fizikal gen pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza ini dikenali sebagai synteny. Selain itu, gen ini didapati sangat rapat antara satu sama lain pada satu kromosom. Susunan gen mungkin tidak semestinya sama. Tetapi, penyetempatan gen berdekatan antara satu sama lain pada kromosom yang sama berlaku secara sintetik. Oleh itu, synteny terutamanya menerangkan corak pengedaran gen pada kromosom. Corak penyetempatan bersama gen ini menunjukkan hubungan antara spesies yang berbeza dan evolusinya. Walau bagaimanapun, synteny boleh terganggu disebabkan oleh penyusunan semula kromosom seperti translokasi, penyongsangan dan gabungan kromosom, dsb. pertindihan, kehilangan dan penggabungan semula homolog yang tidak sama rata.
Rajah 01: Synteny
Adalah dipercayai bahawa semua gen yang dipautkan adalah sintetik. Walau bagaimanapun, tidak semua gen sintenik semestinya dikaitkan. Mereka mempunyai urutan kromosom biasa. Manusia mempunyai banyak gen sintenik dengan mamalia lain. Selain itu, banyak bijirin mempunyai gen sintenik.
Apakah itu Collinearity?
Collinearity ialah bentuk sintetik yang lebih spesifik di mana satu set gen terletak pada kromosom yang sama bagi spesies yang berbeza dalam susunan yang sama seperti dalam spesies nenek moyang. Oleh itu, jika terdapat penyimpangan daripada kolineariti, ia akan menjadi watak filogenetik yang lebih dipercayai kerana kolineariti menerangkan keturunan bersama gen.
Rajah 02: Collinearity
Analisis kolineariti berbilang hala memberikan maklumat yang lebih dipercayai tentang spesies yang berkaitan dan filogeninya.
Apakah Persamaan Antara Synteny dan Collinearity?
- Dalam kedua-dua synteny dan collinearity, satu set lokus dalam dua spesies berbeza terletak pada kromosom yang sama.
- Istilah ini menerangkan penyetempatan bersama fizikal lokus genetik pada kromosom yang sama.
- Collinearity ialah bentuk synteny yang lebih khusus.
- Kadangkala kedua-dua istilah digunakan secara bergantian dalam genomik.
- Jika dua wilayah mempunyai kolineariti, ia jelas bersintesis.
- Ia berguna dalam membuat kesimpulan filogeni.
Apakah Perbezaan Antara Synteny dan Collinearity?
Synteny dan kolineariti ialah dua istilah yang digunakan secara bergantian dalam genomik. Synteny merujuk kepada penyetempatan bersama fizikal set gen dalam kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza. Kolineariti ialah satu bentuk sintetik di mana set gen dilokalkan bersama dalam susunan yang sama antara spesies yang berbeza. Oleh itu, ini ialah perbezaan utama antara synteny dan collinearity.
Ringkasan – Synteny vs Collinearity
Istilah synteny dan collinearity merujuk kepada set gen yang terletak pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza. Malah, gen ini dilokalkan bersama dalam kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza. Synteny menerangkan penyetempatan bersama fizikal gen set pada kromosom yang sama dalam spesies yang berbeza, manakala kolineariti ialah bentuk sinteny yang lebih spesifik di mana set gen disetempatkan bersama dalam susunan yang sama. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara synteny dan collinearity.
