Perbezaan utama antara retrotransposon LTR dan bukan LTR ialah retrotransposon LTR ialah sejenis retrotransposon yang mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya, manakala retrotransposon bukan LTR ialah sejenis retrotransposon yang tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam struktur mereka.
Retrotransposon (elemen transposable kelas I atau transposon melalui perantaraan RNA) ialah sejenis komponen genetik yang boleh menyalin dan menampal sendiri ke lokasi genomik yang berbeza. Mereka melakukan ini dengan menukar RNA kembali ke DNA melalui proses yang dipanggil transkripsi terbalik menggunakan perantaraan transposisi RNA. Terdapat dua jenis retrotransposon utama sebagai retrotransposon LTR dan bukan LTR
Apakah itu LTR Retrotransposon?
LTR retrotransposon ialah sejenis retrotransposon yang mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya. Untaian panjang DNA berulang boleh ditemui pada setiap hujung retrotransposon LTR. Ini dikenali sebagai ulangan terminal panjang (LTR). Setiap LTR adalah beberapa ratus pasangan asas panjang. Retrotransposon LTR biasanya melebihi 5 kilobase panjang. Selain itu, di antara ulangan terminal yang panjang, terdapat gen yang boleh ditranskripsi bersamaan dengan gen retrovirus gag dan pol. Gen ini bertindih supaya ia mengekod protease yang biasanya memproses transkrip yang terhasil menjadi produk gen berfungsi.
Rajah 01: LTR Retrotransposon
Gen gag retrotransposon membuat produk yang mengaitkan dengan transkrip retrotransposon lain untuk membentuk zarah seperti virus. Gen Pol membuat produk yang merangkumi enzim seperti domain transkripase terbalik, integrase, dan ribonuklease H. Enzim transkripase terbalik menjalankan transkripsi terbalik DNA retrotransposon. Enzim integrasi mengintegrasikan DNA retrotransposon ke dalam DNA genom eukariotik. Domain Ribonuclease H membantu dalam membelah ikatan fosfodiester antara perantaraan RNA. Retrotransposon LTR juga mengekod transkrip dengan tapak pengikat tRNA supaya mereka boleh menjalani transkripsi terbalik dengan agak mudah. Tambahan pula, memandangkan retrotransposon mengandungi maklumat genom eukariotik, ia boleh memasukkan salinan dirinya ke lokasi genom lain dalam sel eukariotik.
Apakah itu Retrotransposon Bukan LTR?
Retrotransposon bukan LTR ialah sejenis retrotransposon yang tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya. Seperti retrotransposon LTR, retrotransposon bukan LTR juga mengandungi gen untuk transkripase terbalik, protein pengikat RNA, nuklease, dan kadangkala domain ribonuclease H. Tetapi mereka tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang; sebaliknya, ia mempunyai ulangan pendek yang boleh mempunyai susunan terbalik asas bersebelahan antara satu sama lain. Protein pengikat RNA mengikat kepada perantaraan transposisi RNA, dan nuklease memecahkan ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asid nukleik.
Rajah 02: Retrotransposon LTR dan Bukan LTR
Walaupun ia adalah retrotransposon, ia tidak boleh menjalankan transkripsi terbalik menggunakan perantaraan RNA dengan cara yang sama seperti retrotransposon LTR. Ini kerana retrotransposon bukan LTR tidak mengandungi jujukan yang mengikat tRNA. Oleh itu, retrotransposon bukan LTR yang ditranskripsikan ke dalam mRNA dan diterjemahkan ke dalam protein bertindak sebagai transkripase terbalik. Transkripase terbalik membuat salinan DNA RNA retrotransposon bukan LTR yang boleh disepadukan ke dalam genom di tapak baharu. Tambahan pula, retrotransposon bukan LTR terbahagi kepada dua jenis: LINE (elemen nuklear berselang panjang) dan SINE (elemen nuklear berselang pendek).
Apakah Persamaan Antara Retrotransposon LTR dan Bukan LTR?
- retrotransposon LTR dan bukan LTR ialah dua jenis retrotransposon utama.
- Kedua-dua jenis mengandungi gen untuk enzim seperti reverse transcriptase, protein pengikat RNA, nuklease dan domain ribonuclease H.
- Ia boleh ditemui dalam genom manusia.
- Kedua-dua jenis adalah evolusi penting.
Apakah Perbezaan Antara Retrotransposon LTR dan Bukan LTR?
Retrotransposon LTR mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya, manakala retrotransposon bukan LTR tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara retrotransposon LTR dan bukan LTR. Tambahan pula, retrotransposon LTR mempunyai ulangan langsung yang panjang yang hanya satu jujukan asas yang berulang. Sebaliknya, retrotransposon bukan LTR mempunyai ulangan pendek yang boleh mempunyai susunan terbalik asas bersebelahan antara satu sama lain.
Maklumat di bawah menunjukkan perbezaan antara retrotransposon LTR dan bukan LTR dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – LTR lwn Non-LTR Retrotransposon
LTR dan bukan LTR retrotransposon ialah dua jenis utama retrotransposon. Retrotransposon LTR mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya, manakala retrotransposon bukan LTR tidak mempunyai ulangan terminal yang panjang dalam strukturnya. Jadi, ini ialah perbezaan utama antara retrotransposon LTR dan bukan LTR.
