Perbezaan utama antara pengekstrakan DNA tumbuhan dan haiwan ialah dalam pengekstrakan DNA tumbuhan, adalah perlu untuk memecahkan dinding sel dengan mengisar tisu dalam ais kering atau nitrogen cecair untuk membebaskan kandungan selular semasa dalam pengekstrakan DNA haiwan, langkah ini tidak perlu dilakukan kerana sel haiwan tidak mempunyai dinding sel.
DNA genomik ialah bahan genetik sel tumbuhan dan haiwan. DNA genomik adalah unik untuk setiap tumbuhan atau haiwan individu. Pengekstrakan DNA DNA berkualiti adalah prasyarat untuk penyelidikan molekul. DNA organisma diekstrak untuk pengecaman, diagnosis penyakit, pengesanan gen dan urutan tertentu, tujuan forensik, ujian paterniti, penjujukan genom, dan pembangunan ubat, dsb. Kaedah pengekstrakan DNA berbeza-beza bergantung pada jenis sel – sama ada sel haiwan atau sel tumbuhan.
Apakah Pengekstrakan DNA Tumbuhan?
DNA dalam sel tumbuhan diekstrak untuk pelbagai kajian molekul. Ia diperlukan untuk mengekstrak DNA genomik tulen yang utuh. Oleh itu, terdapat pelbagai jenis protokol pengekstrakan DNA yang berbeza daripada protokol pengekstrakan DNA daripada sel haiwan. Ini kerana sel tumbuhan mempunyai dinding sel yang harus dipecahkan untuk mengeluarkan kandungan selular.
Pengekstrakan biasanya dilakukan dengan mengisar tisu tumbuhan dalam ais kering atau nitrogen cecair menggunakan lesung dan alu. Kemudian membran sel terganggu, dan kandungan selular dibawa keluar ke dalam penimbal pengekstrakan. Ini biasanya dilakukan menggunakan detergen; Penampan SDS (sodium dodecyl sulfate) atau CTAB (cetyltrimethylammonium bromide). DNA yang dibebaskan dilindungi daripada nuklease endogen menggunakan agen pengkelat seperti EDTA. Selain itu, protein diasingkan daripada DNA menggunakan kloroform atau fenol.
Rajah 01: Pengekstrakan DNA Tumbuhan
Tumbuhan mensintesis polisakarida dan polifenol, termasuk flavonoid dan metabolit sekunder lain. Sebatian ini mengganggu pengekstrakan DNA genomik tulen. Oleh itu, kebanyakan protokol pengekstrakan DNA tumbuhan melibatkan langkah lain, seperti teknik kecerunan ketumpatan cesium klorida untuk menghapuskan sebatian ini.
Kebanyakan protokol pengekstrakan DNA mengesyorkan menggunakan sampel daun segar untuk pengekstrakan DNA. Sesetengah kaedah tidak termasuk bahan kimia berbahaya seperti nitrogen cecair dan fenol. Protokol CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) ialah protokol pengekstrakan DNA tumbuhan yang popular yang memudahkan pengekstrakan DNA genomik tumbuhan berkualiti tinggi. Ia adalah kaedah yang mudah, selamat, boleh dipercayai dan menjimatkan kos untuk pengekstrakan DNA tumbuhan. Kebanyakan kaedah lain ialah versi kaedah CTAB yang diubah suai.
Apakah Pengekstrakan DNA Haiwan?
Pengekstrakan DNA haiwan ialah pengekstrakan DNA genomik daripada sel haiwan untuk analisis molekul. Tidak seperti pengekstrakan DNA tumbuhan, pecahan dinding sel tidak diperlukan untuk sel haiwan kerana ia tidak mempunyai dinding sel. Sel darah ialah jenis sel haiwan yang paling biasa digunakan untuk pelbagai tujuan.
Rajah 02: Pengekstrakan DNA
Kaedah fenol-kloroform adalah salah satu pilihan terbaik untuk sel darah. Hasil dan kualiti DNA adalah tinggi apabila mengekstrak DNA daripada kaedah ini. Ia adalah protokol pengekstrakan DNA cecair-cecair, dan kaedah ini mengasingkan molekul DNA berdasarkan keterlarutannya dalam larutan tidak larut. Fenol, kloroform dan isoamil alkohol ialah tiga ramuan teratas kaedah ini.
Apakah Persamaan Antara Pengekstrakan DNA Tumbuhan dan Haiwan?
- Semasa pengekstrakan DNA tumbuhan dan haiwan, membran sel mesti terganggu.
- DNA harus dilindungi daripada nuklease endogen.
- Selain itu, pemotongan DNA harus dicegah.
- Kit komersil tersedia untuk pengekstrakan DNA tumbuhan dan DNA haiwan.
- Kebanyakan kaedah pengekstrakan DNA tumbuhan dan haiwan memerlukan pengubahsuaian dan penyeragaman berterusan.
Apakah Perbezaan Antara Pengekstrakan DNA Tumbuhan dan Haiwan?
Perbezaan utama antara pengekstrakan DNA tumbuhan dan haiwan ialah pengekstrakan DNA tumbuhan memerlukan pengisaran tisu tumbuhan dalam ais kering atau nitrogen cecair untuk memecahkan dinding sel manakala pengekstrakan DNA haiwan tidak memerlukan langkah ini kerana ia haiwan sel tidak mempunyai dinding sel. Kaedah CTAB ialah salah satu kaedah terbaik untuk pengekstrakan DNA tumbuhan manakala kaedah fenol-kloroform adalah salah satu kaedah terbaik untuk pengekstrakan DNA haiwan.
Di bawah maklumat grafik menjadualkan perbezaan antara pengekstrakan DNA tumbuhan dan haiwan.
Ringkasan – Pengekstrakan DNA Tumbuhan vs Haiwan
Kaedah berbeza tersedia untuk pengekstrakan DNA daripada jenis sel yang berbeza. Oleh itu, protokol pengekstrakan DNA tumbuhan berbeza daripada protokol pengekstrakan DNA sel haiwan. Pengekstrakan DNA tumbuhan memerlukan gangguan pada dinding sel, membran sel dan membran nuklear manakala pengekstrakan DNA haiwan memerlukan pecahan membran sel dan membran nuklear. Lebih penting lagi, pengekstrakan DNA sel haiwan tidak memerlukan gangguan dinding sel dengan mengisar dalam ais kering atau nitrogen cecair. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara pengekstrakan DNA tumbuhan dan haiwan.
