Perbezaan utama antara primer dan promoter ialah primer ialah jujukan DNA pendek yang disintesis secara komersial yang digunakan dalam PCR untuk penguatan jujukan DNA sasaran manakala promoter ialah jujukan DNA khusus yang menyediakan tapak pengikatan awal yang selamat untuk RNA polimerase dan faktor transkripsi untuk memulakan transkripsi.
Primer dan promoter ialah dua jenis jujukan DNA. Primer ialah serpihan kecil DNA yang diperlukan untuk tindak balas rantai polimerase (PCR). Ia mempunyai jujukan nukleotida pendek yang saling melengkapi dengan hujung mengapit untaian DNA. Terdapat dua jenis primer, dan ia berfungsi sebagai titik permulaan untuk sintesis helai DNA baharu. Sebaliknya, promoter ialah urutan DNA khusus yang terletak di hulu ke tapak permulaan transkripsi gen. Ia secara langsung berinteraksi dengan komponen mekanisme transkripsi seperti polimerase RNA dan faktor transkripsi untuk mengawal transkripsi DNA. Oleh itu, RNA polimerase dan faktor transkripsi lain terikat pada jujukan promoter dan memulakan transkripsi.
Apakah itu Primer?
Primer ialah jujukan DNA pendek yang direka untuk penguatan jujukan DNA sasaran. Secara struktur, mereka mempunyai urutan nukleotida pendek yang melengkapi hujung mengapit helai ganda DNA. Panjangnya biasanya sekitar 20 nukleotida. Semasa PCR, Taq polymerase memangkinkan penambahan nukleotida ke dalam jujukan nukleotida yang sedia ada. Oleh itu, primer berfungsi sebagai titik permulaan untuk sintesis helai baru. Taq polymerase berfungsi hanya dalam arah 5’ hingga 3’. Oleh itu, sintesis DNA juga berlaku dalam arah 5’ hingga 3’ yang sama. Oleh kerana DNA beruntai dua, dua jenis primer diperlukan dalam PCR. Ia dikenali sebagai primer hadapan dan primer terbalik, berdasarkan arah pemanjangan primer semasa sintesis DNA.
Rajah 01: Primer
Sepuh primer ke hadapan dengan helai DNA antisense dan memulakan sintesis + helai gen ke arah 5’ hingga 3’. Ia mempunyai jujukan nukleotida pendek yang merupakan pelengkap kepada hujung 3' mengapit helai antisense. Primer terbalik menyepuh dengan untaian deria dan memulakan sintesis untaian pelengkap untaian pengekodan, iaitu – untaian gen ke arah 5’hingga 3’. Oleh itu, primer terbalik direka bentuk sebagai pelengkap kepada hujung 3' untaian pengekodan. Kedua-dua primer terbalik dan hadapan adalah penting untuk pengeluaran berjuta-juta hingga berbilion salinan kawasan tertentu DNA yang disasarkan atau berminat.
Apakah itu Promoter?
Promotor ialah jujukan DNA yang terletak di hulu atau di hujung 5′ tapak permulaan transkripsi gen. Ia menyediakan tapak pengikat untuk polimerase RNA dan elemen pengawalseliaan tertentu untuk memulakan transkripsi gen. Ia adalah urutan kawal selia yang diperlukan untuk menghidupkan atau mematikan gen. Terdapat urutan nukleotida tertentu dalam promoter. Ia boleh mempunyai 100–1000 pasangan asas. Promoter menunjukkan arah transkripsi. Selain itu, ia menunjukkan untaian deria yang perlu ditranskripsikan.
Rajah 02: Penganjur Gen
Terdapat tiga jenis elemen promoter sebagai promoter teras, promoter proksimal dan promoter distal. Penganjur teras ialah bahagian minimum penganjur yang diperlukan untuk memulakan transkripsi. Ia terletak paling proksimal dengan kodon permulaan. Kotak TATA ialah kawasan terpelihara yang terdapat dalam banyak penganjur teras eukariotik. Ia didapati 25 hingga 35 pasangan asas di hulu tapak permulaan transkripsi. Promoter proksimal didapati lebih hulu ke promoter teras. Secara amnya, ia terletak 250 pasangan asas hulu ke kodon permulaan dan mengandungi elemen pengawalseliaan utama. Promoter distal ditemui di hulu ke promoter proksimal, dan ia mengandungi elemen pengawalseliaan tambahan. Promotor bakteria mempunyai dua unsur jujukan pendek dalam promoternya. TATAAT ialah jujukan konsensus yang terletak di -10 promoter bakteria manakala TTGACA ialah jujukan konsensus pada -35. Ia dikenali sebagai -10 elemen dan -35 elemen.
Apakah Persamaan Antara Primer dan Promoter?
- Primer dan promoter ialah dua jenis jujukan DNA.
- Ia terdiri daripada jujukan nukleotida.
- Kedua-dua primer dan promoter adalah penting untuk ekspresi gen.
Apakah Perbezaan Antara Primer dan Promoter?
Primer ialah jujukan nukleotida pendek yang direka untuk penguatan DNA sasaran. Sebaliknya, promoter ialah urutan DNA pengawalseliaan khusus yang ditemui di hulu ke tapak permulaan transkripsi gen. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara primer dan promoter. Primer adalah kira-kira 20 pasangan asas panjang manakala promoter boleh mempunyai 100 -1000 pasangan asas. Secara fungsional, primer dihidangkan sebagai urutan permulaan untuk sintesis helai baharu manakala penganjur mengawal transkripsi gen dengan menyediakan tapak pengikatan untuk polimerase RNA dan faktor transkripsi lain.
Selain itu, promoter ditakrifkan sebagai arah transkripsi dan menunjukkan untaian deria gen. Dari segi struktur, primer ialah jujukan DNA rantai tunggal yang pendek manakala promoter ialah jujukan DNA rantai dua yang panjang.
Grafik maklumat di bawah menjadualkan lebih banyak perbandingan yang berkaitan dengan perbezaan antara primer dan promoter.
Ringkasan – Primer lwn Promoter
Primer ialah jujukan nukleotida pendek yang melengkapi hujung mengapit untai dua DNA sasaran. Dua jenis primer digunakan dalam PCR. Mereka berfungsi sebagai urutan permulaan untuk sintesis helai baru. Primer direka bentuk secara komersial, dan ia adalah jujukan yang stabil suhu. Sebaliknya, promoter ialah urutan pengawalseliaan gen yang terletak di hulu ke tapak permulaan transkripsi. Promoter mengawal transkripsi gen. Mereka menyediakan tapak pengikat untuk polimerase RNA dan faktor transkripsi untuk memulakan transkripsi. Oleh itu, ini ialah ringkasan perbezaan antara primer dan promoter.
