Perbezaan utama antara QTL dan GWAS bergantung pada jenis jujukan yang digunakan dalam analisis. QTL menggunakan lokus gen pautan untuk menganalisis ciri fenotip yang dikaitkan dengan pewarisan poligen manakala GWAS menggunakan jujukan genom keseluruhan untuk menganalisis polimorfisme nukleotida tunggal bagi keadaan tertentu.
Peta QTL dan GWAS memainkan peranan penting dalam analisis genetik untuk sifat yang berbeza. Tambahan pula, mereka penting dalam menganalisis pelbagai keadaan penyakit dengan etiologi yang tidak diketahui. Di samping itu, penjujukan memainkan peranan penting dalam kedua-dua teknik. Teknik ini boleh digandingkan lagi dengan teknik pemprosesan tinggi yang lain untuk meningkatkan ketepatan dan ketepatan.
Apakah itu QTL?
QTL ialah singkatan kepada Quantitative Trait Locus. Ia adalah kawasan DNA yang dikaitkan dengan sifat fenotip. Secara amnya, QTL menimbulkan kesan poligenik. Taburan QTL berbeza-beza, dan bilangan QTL menunjukkan tahap variasi ciri fenotip tertentu. Tambahan pula, mereka biasanya mengekodkan ciri-ciri berterusan yang mendasari dan bukan ciri-ciri diskret.
Setelah mengenal pasti kawasan QTL, adalah penting untuk menyusun kawasan QTL tertentu. Selain itu, untuk memudahkan penyiasatan dan penyelidikan, penjujukan dan penyimpanan data jujukan kawasan QTL biasa berlaku dengan penglibatan bioinformatik. Kami memanggil teknik ini pemetaan QTL. Selepas itu, pangkalan data terbina dengan jujukan rantau QTL.
Rajah 01: Imbasan QTL
Selain itu, aplikasi jujukan QTL bergantung terutamanya pada alat BLAST, di mana persamaan jujukan boleh ditentukan. Ia penting dalam menyimpulkan hubungan antara organisma. Tambahan pula, ia adalah penting dalam menentukan kerumitan fenotip poligenik tertentu. Ia juga menentukan evolusi sifat tertentu.
Pada masa ini, analisis QTL digabungkan dengan teknik pemprosesan tinggi lain seperti susunan mikro DNA. Ini penting dalam analisis ekspresi fenotip. Pada masa ini, saintis sangat berminat untuk membangunkan pangkalan data QTL memandangkan kawasan QTL bertanggungjawab terhadap banyak ciri penting spesies yang berbeza.
Apakah itu GWAS?
GWAS ialah singkatan dari Genome Wide Association Study. Ia juga merujuk kepada kajian persatuan genom keseluruhan. Kajian ini tertumpu terutamanya kepada kajian pemerhatian. Ia menganalisis varian genetik individu berbeza yang biasanya dikaitkan dengan sifat tertentu. Selain itu, keseluruhan genom adalah penting untuk analisis GWAS.
Rajah 02: GWAS
GWAS ialah alat penting dalam analisis polimorfisme nukleotida tunggal yang dikaitkan dengan pelbagai keadaan penyakit. Ini juga merupakan kajian perbandingan polimorfisme nukleotida tunggal yang berbeza merentasi populasi yang luas. Selain itu, sampel kajian GWAS adalah sangat tinggi; oleh itu, ia juga mengambil format kajian kohort keratan rentas.
Selain itu, kajian GWAS yang pertama berlaku berkenaan dengan infarksi miokardium dan menganalisis gen yang berkaitan dengan infarksi miokardium. Pada masa ini, GWAS memainkan peranan penting dalam menentukan latar belakang genetik penyakit kompleks dengan etiologi yang tidak diketahui.
Apakah Persamaan Antara QTL dan GWAS?
- Mereka bergantung pada data jujukan DNA untuk analisis.
- Kedua-duanya dikaitkan dengan latar belakang genetik pelbagai watak.
- Selain itu, mereka memerlukan alat bioinformatik untuk menyimpulkan dan mentafsir keputusan.
- Ia dilakukan pada populasi yang besar.
Apakah Perbezaan Antara QTL dan GWAS?
QTL menganalisis sifat fenotip yang dikaitkan dengan warisan poligenik menggunakan lokus gen terpaut manakala GWAS menganalisis polimorfisme nukleotida tunggal bagi keadaan tertentu menggunakan jujukan genom keseluruhan. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara QTL dan GWAS. Pemetaan QTL secara perbandingan adalah teknik yang kurang kompleks berbanding GWAS kerana ia memerlukan penjujukan genom keseluruhan.
Maklumat di bawah meringkaskan perbezaan antara QTL dan GWAS dalam bentuk jadual.
Ringkasan – QTL lwn GWAS
Pemetaan QTL dan GWAS memainkan peranan utama dalam menentukan latar belakang genetik pelbagai sifat fenotip. Mereka juga membantu dalam menganalisis latar belakang genetik penyakit yang berbeza. Pemetaan QTL memetakan gen kaitan yang bertanggungjawab untuk sifat berterusan, dan juga melibatkan pemetaan gen warisan poligenik. GWAS, sebaliknya, berlaku dengan analisis genom keseluruhan untuk polimorfisme nukleotida tunggal. Di samping itu, ini berlaku merentasi populasi yang lebih besar. Oleh itu, ini ialah ringkasan perbezaan antara QTL dan GWAS.
