Perbezaan utama antara proteomik yang disasarkan dan tidak disasarkan ialah proteomik yang disasarkan bertujuan untuk mengukur kelimpahan protein tertentu manakala proteomik yang tidak disasarkan tidak menyasarkan protein tertentu.
Proteomics ialah kajian berskala besar tentang protein, struktur dan fungsinya. Ia mengkaji keseluruhan pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma dalam keadaan tertentu. Terdapat dua jenis proteomik sebagai proteomik disasarkan dan proteomik tidak disasarkan.
Apakah itu Targeted Proteomics?
Seperti namanya, proteomik yang disasarkan menyasarkan protein tertentu atau peptida dalam campuran kompleks protein untuk analisis. Kemudian ia menganalisis kehadiran dan kuantiti protein khusus yang telah dipilih sebelumnya. Kaedah ini boleh dilakukan untuk satu sampel sahaja atau merentasi berbilang sampel. Kaedah ini sesuai walaupun untuk kumpulan protein tertentu. Ia menghasilkan data yang lebih tepat, kuantitatif dan sensitif. Selain itu, spektrometri jisim ditambah dengan proteomik yang disasarkan menghasilkan ukuran yang boleh dipercayai yang lebih tepat. Kaedah ini menggunakan spektrometer jisim kuadrupole tiga kali ganda (QQQ) untuk analisisnya.
Rajah 01: Proteomik
Proteomik yang disasarkan ialah kaedah yang sesuai jika anda ingin mengesahkan sama ada sasaran knockdown sebenarnya telah dirobohkan atau apabila anda ingin mengukur protein/peptida tertentu dalam serum darah, cecair serebrum atau dalam lisat sel dll. Anda juga boleh gunakannya jika anda ingin menyemak sama ada protein tertentu dinyatakan secara berbeza merentas sampel atau semasa percubaan kursus masa.
Apakah itu Untargeted Proteomics?
Proteomik tidak disasarkan, seperti namanya, tidak menyasarkan protein atau peptida tertentu untuk analisisnya. Proteomik penemuan ialah nama lain untuk proteomik Tidak disasarkan. Malah, ia adalah analisis yang lebih 'global'. Secara amnya, melaksanakan proteomik yang tidak disasarkan adalah untuk menjawab soalan "apakah protein atau protein dalam sampel ini atau berbilang sampel?". Kaedah ini tidak sensitif sebagai proteomik yang disasarkan. Tetapi ia boleh mengenal pasti dan mengukur banyak protein termasuk protein baru. Proteomik yang tidak disasarkan boleh menghasilkan pengukuran kuantitatif dan kualitatif.
Apakah Persamaan Antara Proteomik Sasaran dan Tidak Sasaran?
- Proteomik disasarkan dan tidak disasarkan mengukur protein dalam sampel.
- Ia penting dalam analisis proteome.
- Kaedah ini menggunakan spektrometri jisim.
Apakah Perbezaan Antara Proteomik Sasaran dan Tidak Sasaran?
Pertama, proteomik yang disasarkan ialah penentuan kehadiran dan kuantiti protein atau peptida tertentu dalam campuran kompleks protein. Sebaliknya, proteomik tidak disasarkan ialah kajian kuantitatif dan kualitatif protein yang terdapat dalam sampel atau sampel tanpa menyasarkan protein tertentu. Proteomik yang disasarkan dilakukan dengan protein yang telah dipilih atau disasarkan manakala proteomik yang tidak disasarkan dilakukan untuk mengetahui jenis protein dalam sampel ini. Selain itu, proteomik yang disasarkan adalah lebih sensitif daripada proteomik yang tidak disasarkan.
Ringkasan – Proteomik Sasaran vs Tidak Sasaran
Ringkasnya, proteomik yang disasarkan dan tidak disasarkan ialah dua jenis kajian protein. Seperti yang dicadangkan oleh namanya, proteomik yang disasarkan menyasarkan protein tertentu manakala proteomik yang tidak disasarkan tidak menyasarkan protein tertentu. Ini ialah perbezaan antara proteomik disasarkan dan tidak disasarkan.
