Perbezaan utama antara xylene cyanol dan bromophenol blue ialah dalam 1% agarose gel, xylene cyanol berhijrah lebih perlahan, manakala bromophenol blue berhijrah lebih cepat.
Xylene cyanol dan bromophenol blue adalah penting sebagai penanda warna yang boleh digunakan dalam memantau proses elektroforesis gel agarose dan elektroforesis gel poliakrilamida.
Apakah itu Xylene Cyanol?
Xylene cyanol ialah penanda warna elektroforesis atau pewarna pengesan. Ia berguna dalam memantau proses elektroforesis gel agarose dan elektroforesis gel poliakrilamida. Apabila bahan ini dicampur dengan sampel, kepekatan bahan ini biasanya menjadi kira-kira 0.005% hingga 0.03%. Beberapa sinonim yang boleh kita gunakan untuk xylene cyanol termasuk Acid Blue 147, xylene cyanole, xylene cyanol FF, xylene cyanole FF, dsb.
Formula kimia sebatian ini ialah C25H27N2NaO 6S2 Jisim molar xylene cyanol ialah 538.61 g/mol. Bahan ini boleh berhijrah pada kadar kira-kira 4 – 5 kilobase serpihan pasangan DNA dalam 1% gel agarose. Walau bagaimanapun, ini bergantung kepada penimbal yang kita gunakan. Lazimnya, xylene cyanol pada gel poliakrilamida 6% boleh berhijrah pada kelajuan kira-kira 140 serpihan DNA pasangan asas. Sebaliknya, ia boleh berhijrah dalam elektroforesis gel poliakrilamida denaturasi 20% pada kadar 25 bes oligonukleotida.
Bilangan penderma ikatan hidrogen bagi xylene cyanol ialah 2m, dan kiraan penerima ikatan hidrogen ialah 8. Kiraan ikatan boleh putar bagi sebatian ini boleh diberikan sebagai 7. Kerumitan xilena cyanol boleh digambarkan sebagai 1120 darjah. Ia mempunyai kiraan stereocenter bon yang ditentukan sebanyak 1.
Apakah itu Bromophenol Blue?
Bromophenol blue ialah penunjuk pH berguna yang berguna sebagai penanda warna elektroforesis dan pewarna. Ia mempunyai nama kimia 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromophenolsulfonphthalein, BPB. Formula kimia sebatian ini ialah C19H10Br4O5 S. Jisim molar sebatian ini ialah 669.96 g/mol. Ia tidak berbau, dan ketumpatannya boleh diberikan sebagai 2.2 g/mL. Takat leburnya ialah 273 darjah Celsius, dan takat didihnya ialah 279 darjah Celsius. Kita boleh menyediakannya dengan menambahkan bromin berlebihan secara perlahan-lahan kepada larutan panas fenolsulfonftalein dalam asid asetik glasier.
Bromophenol blue berguna sebagai penunjuk asid-bes dalam julat antara pH 3.0 hingga 4.6. Ia mampu berubah daripada kuning pada pH 3.0 kepada pH 4.6. Lebih-lebih lagi, ia adalah tindak balas yang boleh diterbalikkan. Dari segi struktur, bromofenol biru adalah serupa dengan fenolftalein.
Selain itu, kita boleh menggunakannya sebagai penanda warna untuk memantau proses elektroforesis gel agarose dan elektroforesis gel poliakrilamida. Bahan ini boleh membawa cas negatif pada pH sederhana, di mana ia boleh berhijrah ke arah yang sama seperti DNA atau protein dalam gel. Kadar migrasi boleh berbeza-beza mengikut kepadatan gel dan komposisi penimbal. Walau bagaimanapun, dalam gel agarosa 1% biasa dalam 1 kali penimbal TAE atau penimbal TBE, bahan ini berhijrah pada kadar yang sama seperti serpihan DNA kira-kira 300 pasangan asas.
Apakah Perbezaan Antara Xylene Cyanol dan Bromophenol Blue?
Xylene cyanol dan bromophenol blue ialah penanda warna yang penting. Perbezaan utama antara xylene cyanol dan bromophenol blue ialah dalam 1% agarose gel, xylene cyanol berhijrah lebih perlahan, manakala bromophenol blue berhijrah lebih cepat.
Di bawah ialah ringkasan perbezaan antara xylene cyanol dan bromophenol blue dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue
Xylene cyanol dan bromophenol blue adalah penting sebagai penanda warna yang digunakan dalam memantau proses elektroforesis gel agarose dan elektroforesis gel poliakrilamida. Perbezaan utama antara xylene cyanol dan bromophenol blue ialah dalam 1% agarose gel, xylene cyanol berhijrah lebih perlahan manakala bromophenol blue berhijrah lebih cepat.
