Perbezaan utama antara pemprofilan polisom dan pemprofilan ribosom ialah pemprofilan polisom menganalisis gelagat ribosom menggunakan kedua-dua ribosom dan mRNA (polisom) semasa terjemahan, manakala pemprofilan ribosom menganalisis gelagat ribosom hanya menggunakan jujukan mRNA semasa terjemahan.
Terjemahan ialah fasa kedua sintesis protein yang menukar maklumat dalam mRNA kepada urutan asid amino. Translatomics ialah kajian tentang ORF (bingkai bacaan terbuka) yang diterjemahkan secara aktif dalam sel organisma. Teknik pemprofilan polisom dan ribosom ialah dua jenis teknik dalam bidang biologi molekul untuk menilai dan membuat kesimpulan parameter yang berbeza dalam konteks menganalisis penterjemahan.
Apakah itu Polysome Profiling?
Pemprofilan polisom ialah teknik yang menyimpulkan status terjemahan mRNA tertentu dengan menganalisis kelakuan kedua-dua ribosom dan mRNA (polisom). Dalam erti kata lain, teknik ini menyediakan data dan kesimpulan mengenai persatuan mRNA dengan ribosom. Polisom merujuk kepada kumpulan ribosom yang terikat pada mRNA yang terdapat semasa fasa pemanjangan terjemahan.
Rajah 01: Pemprofilan Polisom
Pemprofilan polisom memerlukan lisat sel, yang kemudiannya disentrifugasi. Sampel yang disentrifugasi kemudiannya diasingkan berdasarkan kepadatannya untuk mencirikan subunit kecil dan besar ribosom dan mRNA yang sepadan yang terlibat dalam pembentukan polisom. Tambahan pula, proses itu juga melibatkan pengukuran ketumpatan optik. Pakar dikehendaki melakukan pemprofilan polysome.
Teknik pemprofilan polisom ialah alat penting untuk banyak aplikasi. Para saintis menggunakan teknik ini untuk mengkaji tahap terjemahan dalam sel. Lebih khusus lagi, ia adalah alat untuk memberikan maklumat yang tepat mengenai kajian protein individu dan mRNA khusus mereka. Dalam konteks mengkaji tahap terjemahan mRNA tertentu, teknik pemprofilan polisom adalah penting. Di sini, urutan 3' dan 5' mRNA boleh disiasat dengan merujuk kepada kesannya terhadap jumlah mRNA yang dihasilkan dan tahap terjemahan.
Apakah itu Pemprofilan Ribosom?
Pemprofilan ribosom ialah teknik yang menganalisis kelakuan ribosom berkenaan dengan mRNAnya semasa terjemahan. Teknik ini ditemui dan dibangunkan oleh Joan Steitz dan Marilyn Kozak. Kemudian teknologi ini dikembangkan lagi oleh dua saintis, Nicholas dan Jonathan, dalam kombinasi dengan penjujukan generasi akan datang, yang membawa kepada pembangunan teknik berkaitan yang berbeza seperti Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) metodologi.
Rajah 02: Penjujukan Ribosom
Prosedur pemprofilan ribosom melibatkan pengasingan mRNA, mengeluarkan RNA yang tidak terikat pada ribosom, dan mengasingkan mRNA yang terikat pada ribosom. Mengikuti prosedur ini, pengasingan mRNA ditranskripsi terbalik, dan sintesis cDNA berlaku. Akhir sekali, data jujukan boleh diselaraskan dengan profil translasi untuk menyimpulkan ciri-ciri tingkah laku ribosom berkenaan dengan mRNA.
Pemprofilan ribosom membantu ramai penyelidik mengenal pasti dan membuat kesimpulan lokasi tapak permulaan terjemahan, pelengkap bingkai bacaan terbuka (ORF) diterjemahkan dalam sel atau tisu, pengedaran ribosom pada mRNA, dan kadar menterjemah ribosom. Pemprofilan ribosom juga dikenali sebagai jejak ribosom atau Ribo Seq.
Apakah Persamaan Antara Pemprofilan Polisom dan Pemprofilan Ribosom?
- Pemprofilan polisom dan ribosom ialah teknik biologi molekul yang penting dalam penyelidikan.
- Mereka memberikan maklumat tentang proses terjemahan.
- Kedua-dua proses pemprofilan menyediakan data melalui analisis terjemahan.
- Pakar profesional diperlukan untuk melaksanakan kedua-dua teknik untuk mendapatkan hasil yang tepat.
- Alat bioinformatik memainkan peranan penting dalam kedua-dua teknik.
Apakah Perbezaan Antara Pemprofilan Polisom dan Pemprofilan Ribosom?
Pemprofilan polisom menganalisis gelagat ribosom menggunakan kedua-dua ribosom dan mRNA (polisom) semasa terjemahan, manakala pemprofilan ribosom menganalisis gelagat ribosom hanya menggunakan jujukan mRNA semasa terjemahan. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara pemprofilan polisom dan pemprofilan ribosom. Selain itu, pemprofilan polisom melibatkan teknik seperti sentrifugasi kecerunan ketumpatan dan pengukuran ketumpatan optik, manakala pemprofilan ribosom melibatkan teknik pengekstrakan dan penjujukan mRNA. Selain itu, pemprofilan ribosom adalah lebih tepat daripada pemprofilan polisom.
Maklumat di bawah menunjukkan perbezaan antara pemprofilan polisom dan ribosom dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – Pemprofilan Polisom lwn Pemprofilan Ribosom
Terjemahan ialah fasa kedua sintesis protein yang melibatkan penukaran maklumat pada jujukan mRNA kepada jujukan asid amino. Proses ini memerlukan templat mRNA, ribosom, asid amino, tRNA dan faktor lain. Profil polisom dan ribosom adalah dua teknik molekul. Pemprofilan polisom menganalisis tingkah laku ribosom menggunakan kedua-dua ribosom dan mRNA (polisom) semasa terjemahan, manakala pemprofilan ribosom menganalisis tingkah laku ribosom hanya menggunakan jujukan mRNA semasa terjemahan. Pemprofilan polisom melibatkan teknik seperti sentrifugasi kecerunan ketumpatan dan pengukuran ketumpatan optik. Pemprofilan ribosom melibatkan teknik seperti pengekstrakan mRNA, sintesis cDNA, dan penjujukan. Jadi, ini meringkaskan perbezaan antara pemprofilan polisom dan pemprofilan ribosom.
