Perbezaan utama antara CGH dan tatasusunan CGH ialah CGH ialah kaedah sitogenetik molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih rendah, manakala tatasusunan CGH ialah kaedah sitogenetik molekul automatik sepenuhnya untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi lebih tinggi.
CGH dan tatasusunan CGH ialah dua teknik untuk mengesan variasi nombor salinan dalam individu. Variasi nombor salinan merujuk kepada bahagian genom yang diulang. Nombor salinan berbeza antara individu. Variasi nombor salinan biasanya dikategorikan kepada dua kumpulan: ulangan pendek dan ulangan panjang. Salah satu contoh yang paling terkenal untuk variasi nombor salinan pendek ialah pengulangan trinukleotida CAG dalam gen huntingtin. Ini menyebabkan gangguan neurologi yang dipanggil huntingtin. Contoh terbaik untuk variasi nombor salinan ulangan yang lama ialah gen alfa amilase, yang menyebabkan rintangan insulin. Variasi nombor salinan boleh dikesan melalui teknik seperti FISH, CGH dan tatasusunan CGH.
Apakah itu CGH?
CGH ialah kaedah sitogenetik molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian berbanding sampel rujukan. Ia mempunyai resolusi yang lebih rendah berbanding dengan teknik automatik. Objektif teknik ini adalah untuk membandingkan dua sampel DNA genom dengan cepat dan cekap yang timbul daripada sumber yang berbeza.
Rajah 01: CGH
Prosedur melibatkan pengasingan DNA daripada dua sumber: ujian dan rujukan. Kemudian langkah seterusnya ialah pelabelan bebas bagi ujian dan rujukan sampel DNA dengan fluorofor berwarna berbeza. Kemudian, kedua-dua sampel DNA telah didenatur untuk mendapatkan sampel DNA untai tunggal. Akhirnya, penghibridan dua sampel DNA yang terhasil dalam nisbah 1:1 kepada penyebaran metafasa normal kromosom telah dilakukan. Perbezaan kromosom boleh dikenal pasti antara dua sumber menggunakan mikroskop pendarfluor dan perisian komputer. Tambahan pula, teknik CGH hanya dapat mengesan keabnormalan kromosom yang tidak seimbang.
Apakah Array CGH?
Array CGH ialah kaedah sitogenetik molekul automatik sepenuhnya untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian berbanding sampel rujukan. Ia mempunyai resolusi yang lebih tinggi, dan ia dibangunkan untuk meminimumkan batasan CGH tradisional. Array CGH menggabungkan prinsip CGH dengan penggunaan microarrays. Daripada menggunakan penyebaran kromosom metafasa, kaedah ini menggunakan slaid yang disusun dengan segmen kecil DNA sebagai sasaran. Microarrays ini dibuat dengan mendepositkan dan melumpuhkan sejumlah kecil DNA (probe) pada sokongan kaca pepejal. Saiz probe boleh berbeza-beza daripada oligonukleotida kepada kromosom buatan bakteria.
Rajah 02: Tatasusunan CGH
Tidak kira probe, kaedah asas tatasusunan CGH adalah serupa dengan CGH. Setelah probe yang mengandungi microarray disediakan, kedua-dua sampel DNA (ujian dan rujukan) yang dilabelkan dengan fluorophores berbeza warna dicampurkan bersama dan ditambah pada microarray. Memandangkan DNA dalam sampel adalah untai tunggal akibat denaturasi, DNA ini berhibrid dengan probe untaian tunggal tersusun. Menggunakan sistem pengimejan digital, adalah mungkin untuk mengenal pasti perbezaan kromosom antara kedua-dua sumber.
Apakah Persamaan Antara CGH dan Array CGH?
- CGH dan tatasusunan CGH ialah dua teknik untuk mengesan variasi nombor salinan.
- Ia adalah kaedah sitogenetik molekul.
- Kedua-dua kaedah mendiagnosis keabnormalan kromosom yang tidak seimbang.
- Fluorofor terlibat dalam kedua-dua kaedah.
- Kedua-dua kaedah boleh digunakan untuk mengesan gangguan genetik akibat variasi nombor salinan.
- Ia digunakan secara meluas dalam analisis genomik perbandingan.
Apakah Perbezaan Antara CGH dan Array CGH?
CGH ialah kaedah sitogenetik molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih rendah, manakala tatasusunan CGH ialah kaedah sitogenetik molekul automatik sepenuhnya untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih tinggi. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara CGH dan tatasusunan CGH. Tambahan pula, dalam CGH, sampel DNA ujian dan rujukan berhibrid dengan penyebaran metafasa normal kromosom, tetapi dalam tatasusunan CGH, sampel DNA ujian dan rujukan berhibrid dengan probe DNA tidak bergerak yang mengandungi mikroarray.
Maklumat di bawah menyenaraikan perbezaan antara CGH dan tatasusunan CGH dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – CGH lwn Array CGH
CGH dan tatasusunan CGH ialah dua teknik sitogenetik molekul untuk mengesan keabnormalan kromosom yang tidak seimbang. Ia digunakan secara meluas dalam analisis genomik perbandingan. CGH ialah kaedah sitogenetik molekul tradisional untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih rendah. Sebaliknya, tatasusunan CGH ialah kaedah sitogenetik molekul automatik sepenuhnya untuk menganalisis variasi nombor salinan dalam DNA sampel ujian yang mempunyai resolusi yang lebih tinggi. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara CGH dan tatasusunan CGH.
