Perbezaan utama antara LINE dan SINE ialah LINE (elemen nuklear berselang panjang) ialah sejenis retrotransposon bukan LTR yang lebih panjang manakala SINE (elemen nuklear berselang pendek) ialah sejenis retrotransposon bukan LTR yang jauh lebih pendek.
Retrotransposon bukan LTR tidak mengandungi ulangan terminal panjang (LTR). Walau bagaimanapun, ia mengandungi gen untuk transkripase terbalik, protein pengikat RNA, nuklease, dan domain ribonuclease H. Retrotransposon bukan LTR mempunyai ulangan yang singkat. Ulangan ini mempunyai susunan asas terbalik bersebelahan antara satu sama lain. Selain itu, retrotransposon bukan LTR juga mempunyai ulangan langsung yang terdapat dalam transposon LRT. Retrotransposon bukan LTR terbahagi kepada dua kategori sebagai LINE dan SINE.
Apakah itu LINEs?
LINEs (elemen nuklear berselang panjang) ialah retrotransposon bukan LTR yang lebih panjang. Mereka tersebar luas dalam genom eukariota. Mereka biasanya membentuk 21.1% daripada genom manusia. Setiap LINE adalah sekitar 7000 pasangan asas panjang. LINEs boleh menyalin ke dalam mRNA dan diterjemahkan ke dalam protein yang boleh berfungsi sebagai enzim transkripase terbalik. Transkripase terbalik ini menghasilkan salinan DNA RNA LINE. Salinan DNA ini boleh disepadukan ke dalam genom di tapak baharu.
Rajah 01: GARIS dan SIN
Genom manusia hanya mempunyai satu LINE yang banyak dipanggil LINE-1. Elemen LINE-1 adalah sekitar 6000 pasangan asas panjang. Terdapat kira-kira 100, 000 elemen LINE-1 terpotong dalam genom manusia. Mutasi rawak boleh berlaku dalam LINE. Disebabkan mutasi rawak, LINE boleh merosot. Mereka tidak lagi ditranskripsi atau diterjemahkan. Tambahan pula, LINE dikelompokkan kepada lima kumpulan utama seperti L1, RTE, R2, I dan joki. Lima kumpulan ini terus membahagikan kepada 28 klad lagi.
LINEs biasanya disebarkan melalui mekanisme yang dipanggil mekanisme transkripsi terbalik (TPRT) sasaran. Memasukkan LINE menyebabkan penyakit manusia seperti haemofilia A, kanser, gangguan mendelian, dll. Hypomethylation LINEs juga mencetuskan jenis kanser tertentu.
Apakah itu SINE?
SINE (elemen nuklear berselang pendek) ialah sejenis retrotransposon bukan LTR yang jauh lebih pendek. Panjangnya kira-kira 100 hingga 700 pasangan asas. SINE juga merupakan unsur DNA yang menguatkan diri mereka di seluruh genom eukariotik melalui perantaraan RNA. SINE membentuk kira-kira 13% daripada genom mamalia. Kawasan dalaman SINE berasal daripada tRNA. Ia kekal sangat terpelihara. Mereka sering terdapat dalam banyak spesies vertebrata dan invertebrata. Variasi nombor salinan dan mutasi dalam SINE boleh digabungkan untuk membina klasifikasi spesies berasaskan filogeni.
SIN boleh dikumpulkan kepada tiga jenis utama: CORE-SIN, V-SINE dan AmnSINE. Unsur Alu ialah SIN yang paling biasa dalam primata. Lebih-lebih lagi, terdapat lebih daripada 50 penyakit manusia yang dikaitkan dengan kemasukan SIN. Apabila ia memasukkan dalam atau berhampiran ekson, ia boleh menyebabkan penyambungan yang tidak betul atau menukar bingkai bacaan. Ini membawa kepada fenotip penyakit seperti kanser payudara, kanser kolon, leukemia, hemofilia, cystic fibrosis, kanser kolon, penyakit Dent, neurofibromatosis, dll.
Apakah Persamaan Antara LINE dan SINE?
- LINEs dan SINEadalah dua jenis retrotransposon bukan LTR.
- Kedua-duanya tidak mempunyai kawasan terminal panjang (LTR).
- Kedua-duanya kebanyakannya hanya terdapat dalam eukariota.
- Kedua-duanya bukan autonomi.
Apakah Perbezaan Antara LINE dan SINE?
LINEs adalah retrotransposon bukan LTR yang lebih panjang, manakala SINE adalah retrotransposon bukan LTR yang jauh lebih pendek. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara LINE dan SINE. Tambahan pula, kod LINES untuk enzim transkripase terbalik, manakala SINE tidak kod untuk enzim transkripase terbalik. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara LINE dan SINE.
Lebih banyak perbezaan antara LINE dan SINE disenaraikan di bawah dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – LINEs vs SINEs
Retrotransposon kebanyakannya terdapat dalam semua eukariota tetapi tiada dalam prokariot. Kira-kira, 37% daripada genom manusia mengandungi retrotransposon. Retrotransposon terutamanya dua jenis: LTR dan Non-LTR retrotransposon. Retrotransposon bukan LTR tidak mengandungi ulangan terminal panjang (LTR), yang terdapat dalam retrotransposon LTR. Retrotransposon bukan LTR dibahagikan lagi kepada dua kategori: LINE dan SINE. LINE adalah retrotransposon bukan LTR yang lebih panjang, manakala SINE adalah retrotransposon bukan LTR yang jauh lebih pendek. Oleh itu, ini ialah ringkasan perbezaan antara LINE dan SINE.
