Perbezaan utama antara serine dan tyrosine recombinase ialah dalam serine recombinase, serine ialah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan semula khusus tapak, manakala dalam tyrosine recombinase, tyrosine ialah asid amino nukleofilik yang digunakan. oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan semula khusus tapak.
Penggabungan semula khusus tapak (penggabungan semula khusus tapak konservatif) ialah sejenis teknik penggabungan semula genetik di mana pertukaran untai DNA berlaku antara segmen yang mempunyai tahap homologi jujukan tertentu. Rekombinasi khusus tapak mengawal proses penggabungan semula khusus tapak. Enzim ini dikelompokkan kepada dua keluarga sebagai keluarga serine recombinase dan keluarga tyrosine recombinase. Nama-nama tersebut berasal daripada sisa asid amino nukleofilik terpelihara yang terdapat dalam dua kelas rekombinasi di atas yang digunakan untuk menyerang DNA dan yang menjadi dikaitkan secara kovalen kepadanya semasa pertukaran helai dalam penggabungan semula khusus tapak.
Apakah Serine Recombinase?
Dalam kaedah penggabungan semula khusus tapak, dua jujukan DNA pendek (‘tapak sasaran’) dipotong pada titik tertentu dalam kedua-dua helai, dan hujung yang dipotong dicantumkan semula kepada rakan kongsi baharu. Teknologi penggabungan semula khusus tapak ialah alat genomik dalam kejuruteraan genetik yang bergantung kepada enzim rekombinasi untuk menggantikan bahagian sasaran DNA. Banyak sistem penggabungan semula khusus tapak telah didapati melakukan penyusunan semula DNA ini untuk tujuan yang berbeza. Tetapi semua enzim rekombinase ini tergolong dalam dua keluarga. Serine recombinase adalah salah satu daripadanya. Mereka boleh mengantara sehingga tiga jenis penyusunan semula DNA: penyepaduan, pengasingan dan penyongsangan.
Rajah 01: Serine Recombinase
Rekombinasi khusus tapak seperti serine recombinase melakukan penyusunan semula DNA dengan mengecam dan mengikat pada urutan DNA pendek (tapak sasaran), di mana ia membelah tulang belakang DNA. Kemudian, pertukaran dua heliks DNA berlaku dan penyatuan semula helai DNA berlaku. Dalam serine recombinase, serine ialah asid amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan semula khusus tapak. Semasa pembelahan DNA, ikatan protein-DNA terbentuk melalui tindak balas transesterifikasi. Ikatan fosfodiester digantikan dengan ikatan fosfoserin antara kumpulan 5'fosfat di tapak belahan dan kumpulan hidroksil sisa serin terpelihara. Ikatan baru menyimpan tenaga yang dibelanjakan untuk membelah DNA di tapak sasaran. Tenaga ini kemudiannya digunakan untuk menyambung semula DNA kepada kumpulan hidroksil deoksiribosa yang sepadan di tapak lain. Contoh rekombinasi serine ialah resolvases/invertases serine dan integrase serine.
Apakah itu Tyrosine Recombinase?
Tyrosine recombinase ialah kelas enzim lain yang mengawal penggabungan semula khusus tapak konservatif. Seperti yang diterangkan sebelum ini, tyrosine recombinase juga menjalankan penyusunan semula DNA dengan cara yang sama dengan mengenali dan mengikat pada urutan DNA pendek (tapak sasaran), di mana mereka membelah tulang belakang DNA. Kemudian, pertukaran dua heliks DNA dan penyambungan semula helai DNA berlaku.
Rajah 02: Tyrosine Recombinase
Tetapi dalam tyrosine recombinase, tyrosine ialah asid amino yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan semula khusus tapak. Ciri umum kelas ini ialah sisa tirosin nukleofilik terpelihara yang menyerang DNA-fosfat gunting untuk membentuk hubungan 3'-fosfotirosin. Tyrosine recombinase (A1) dan tyrosine integrases (A2) ialah kumpulan enzim yang menonjol dalam keluarga enzim tyrosine recombinase.
Apakah Persamaan Antara Serine dan Tyrosine Recombinase?
- Ia adalah kelas enzim rekombinase.
- Keduanya mengawal selia penggabungan semula khusus tapak.
- Ia adalah protein.
- Tindak balas kimia asas adalah sama untuk kedua-duanya.
- Kedua-duanya memangkinkan tindak balas transesterifikasi.
Apakah Perbezaan Antara Serine dan Tyrosine Recombinase?
Dalam serine recombinase, serine ialah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan semula khusus tapak. Sebaliknya, dalam tyrosine recombinase, tyrosine ialah asid amino nukleofilik yang digunakan oleh enzim untuk menyerang DNA semasa penggabungan semula khusus tapak. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara serine dan tyrosine recombinase. Ciri umum serine recombinase ialah ia membentuk ikatan phosphoserine dengan DNA, manakala tyrosine recombinase membentuk ikatan phosphotyrosine dengan DNA semasa proses rekombinasi khusus tapak.
Maklumat grafik di bawah menyenaraikan perbezaan antara serin dan tyrosine recombinase dalam bentuk jadual.
-
Perbezaan Antara Serine dan Tyrosine Recombinase dalam Bentuk Tabular
Ringkasan – Serine vs Tyrosine Recombinase
Penggabungan semula boleh berlaku antara molekul DNA yang serupa seperti dalam penggabungan semula homolog atau molekul yang tidak serupa seperti dalam penggabungan semula bukan homolog. Penggabungan semula khusus tapak ialah sejenis penggabungan semula genetik di mana pertukaran untaian DNA berlaku antara segmen yang mempunyai sekurang-kurangnya tahap homologi jujukan tertentu. Ia dimangkinkan oleh rekombinasi. Kebanyakan rekombinasi dikelompokkan kepada dua keluarga: serine recombinase dan tyrosine recombinase. Serine recombinase menggunakan serine sebagai asid amino nukleofilik untuk menyerang DNA semasa proses penggabungan semula khusus tapak. Tyrosine recombinase menggunakan tirosin sebagai asid amino nukleofilik untuk menyerang DNA semasa proses penggabungan semula khusus tapak. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara serine dan tyrosine recombinase.
