Perbezaan utama antara CDS dan ORF ialah CDS ialah jujukan nukleotida sebenar gen yang diterjemahkan kepada protein manakala ORF ialah regangan jujukan DNA yang bermula dengan tapak permulaan terjemahan (kodon permulaan) dan berakhir dengan tapak penamatan terjemahan (kodon henti).
Gen mempunyai urutan pengekodan (CDS). Ia terdiri daripada jumlah ekson gen dan kodon permulaan dan kodon henti. Ia adalah bahagian sebenar gen yang menterjemah dan menghasilkan protein. Bingkai bacaan terbuka atau ORF ialah jujukan nukleotida yang terletak di antara kodon mula dan kodon henti. Tiada kodon henti di dalam ORF yang mengganggu kod genetik yang diterjemahkan ke dalam protein. Dalam prokariot, CDS dan ORF gen adalah sama.
Apakah itu CDS?
CDS atau jujukan pengekodan ialah bahagian gen yang sebenarnya diterjemahkan kepada protein. Ia terdiri daripada ekson dan dua kodon yang dikenali sebagai kodon AUG dan kodon henti. CDS tidak mengandungi dua wilayah Tidak Diterjemah: 5’ UTR dan 3” UTR. Selain itu, intron tidak termasuk dalam CDS.
Rajah 01: Urutan Pengekodan
Jika dibandingkan dengan keseluruhan genom individu, jujukan pengekodan adalah pecahan kecil. Urutan pengekodan terdiri daripada jujukan nukleotida yang diperlukan untuk membuat jujukan asid amino protein. Oleh itu, CDS ialah ekson pekat yang boleh dibahagikan kepada triplet atau kodon nukleotida. Kodon menghasilkan asid amino.
Apakah itu ORF?
Bingkai bacaan terbuka atau ORF ialah regangan berterusan jujukan nukleotida yang bermula dengan kodon permulaan dan berakhir dengan kodon hentian. Dalam kata mudah, ORF merujuk kepada rantau jujukan nukleotida yang terletak di antara kodon mula dan berhenti. Di antaranya, tiada kodon henti yang mengganggu ORF. Urutan nukleotida antara kodon mula dan berhenti mengekod untuk asid amino. Secara amnya, kodon mula ialah ATG manakala kodon henti ialah TAG, TAA dan TGA. ORF memberikan protein berfungsi apabila ditranskripsi dan diterjemahkan. Oleh itu, ORF termasuk kodon permulaan, beberapa kodon di kawasan tengah dan kodon hentian. Menariknya, ORF mempunyai panjang yang boleh dibahagikan dengan tiga.
Rajah 02: Buka Bingkai Bacaan
Dalam prokariot, kerana tiada intron, ORF ialah urutan pengekodan gen yang menyalin terus ke dalam mRNA. Oleh itu, CDS dan PRF adalah sama dalam prokariot. Apabila mencari gen dalam prokariot, mudah untuk mengesan ORF dan mencari gen dalam prokariot. Dalam eukariota, kerana terdapat intron, ORF ialah urutan kodon yang terbentuk selepas pemprosesan atau penyambungan RNA. ORF ialah bukti yang membantu ramalan gen selagi ORF berkemungkinan menjadi sebahagian daripada gen.
Apakah Persamaan Antara CDS dan ORF?
- Dalam prokariot, CDS dan ORF adalah sama.
- Keduanya mempunyai kodon mula dan kodon hentikan.
- Ia mempunyai beberapa nukleotida yang boleh dibahagikan dengan tiga.
- Setelah diterjemahkan, ia menghasilkan urutan asid amino.
Apakah Perbezaan Antara CDS dan ORF?
CDS ialah bahagian sebenar gen yang diterjemahkan kepada protein manakala ORF ialah regangan DNA antara kodon permulaan dan kodon hentian. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara CDS dan ORF. Tambahan pula, CDS tidak mengandungi intron, tetapi ORF mungkin mengandungi intron. CDS menyalin sepenuhnya ke dalam urutan mRNA yang lengkap manakala ORF boleh menjadi sebahagian daripada jujukan mRNA. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara CDS dan ORF.
Di bawah jadual maklumat grafik bersebelahan perbezaan antara CDS dan ORF.
Ringkasan – CDS lwn ORF
CDS dan ORF ialah dua bahagian penting gen. CDS merujuk kepada kawasan sebenar DNA yang diterjemahkan kepada protein. ORF ialah jujukan DNA yang bermula dengan kodon permulaan "ATG" dan berakhir dengan mana-mana daripada tiga kodon penamatan (TAA, TAG atau TGA). ORF mungkin sebahagian daripada mRNA lengkap gen. Walau bagaimanapun, urutan pengekodan gen menyalin untuk melengkapkan urutan mRNA. Semua CDS adalah ORF. Tetapi tidak semua ORF adalah CDS. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara CDS dan ORF.
