Perbezaan utama antara dok molekul dan pemarkahan ialah dok ialah teknik yang digunakan untuk menentukan pertalian pengikatan antara dua molekul manakala pemarkahan ialah proses menilai pose tertentu dengan mengira bilangan interaksi antara molekul yang menguntungkan.
Istilah dok molekul dan pemarkahan digunakan dalam bidang pemodelan molekul. Pemodelan molekul ialah teknik yang digunakan untuk menentukan kemungkinan susunan molekul berbeza dalam bahan tertentu. Teknik ini penting dalam mencipta sebatian stabil baharu.
Apakah itu Docking Molecular?
Docking molekul ialah simulasi pengiraan ligan calon yang terikat pada reseptor. Kaedah ini meramalkan orientasi pilihan satu molekul ke molekul lain apabila terikat antara satu sama lain untuk membentuk kompleks yang stabil. Keputusan yang diperoleh daripada teknik ini boleh digunakan untuk meramalkan kekuatan perkaitan atau pertalian pengikatan antara dua molekul. Di sini, fungsi pemarkahan molekul juga penting.
Rajah 01: Gambarajah Mudah yang menunjukkan Proses Interaksi Molekul dalam Sistem Biologi
Secara amnya, teknik ini mempertimbangkan molekul yang berkaitan secara biologi seperti protein, peptida, asid nukleik, karbohidrat dan lipid. Molekul ini sangat penting, dan ia memainkan peranan penting dalam mekanisme transduksi isyarat dalam badan kita. Oleh itu, orientasi dua molekul yang akan mengikat untuk proses transduksi isyarat ini mempengaruhi jenis isyarat yang dihasilkan di sini. Maksudnya; dok molekul adalah penting dalam menentukan kedua-dua kekuatan dan jenis isyarat yang dihasilkan semasa transduksi isyarat dalam sistem biologi.
Selain itu, teknik dok molekul penting dalam mereka bentuk ubat berasaskan struktur. Ini disebabkan oleh kebolehramalannya untuk mengikat konformasi molekul kecil seperti ligan ke tapak pengikatan yang sesuai.
Apakah Pemarkahan Molekul?
Pemarkahan molekul ialah sejenis fungsi matematik yang berguna dalam menilai kemajuan dok molekul. Dalam bidang kimia pengiraan, fungsi pemarkahan digunakan untuk meramalkan pertalian pengikatan antara dua molekul selepas proses dok. Sebagai contoh, jika kita mempunyai molekul kecil ubat zarah dan terdapat sasaran biologi seperti protein, kita boleh menilai pertalian ubat terhadap tapak pengikatan. Selain itu, pemarkahan molekul boleh digunakan untuk meramalkan interaksi antara molekul antara dua protein atau antara protein dan molekul DNA.
Rajah 02: Fungsi Pemarkahan secara Ringkas
Aplikasi utama pemarkahan molekul adalah dalam proses reka bentuk ubat-contohnya, saringan maya, reka bentuk de novo, pengoptimuman plumbum, dsb.
Apakah Perbezaan Antara Docking Molekul dan Pemarkahan?
Docking dan pemarkahan molekul penting dalam pemodelan molekul. Perbezaan utama antara dok molekul dan pemarkahan ialah dok ialah teknik yang digunakan untuk menentukan pertalian pengikatan antara dua molekul manakala pemarkahan ialah proses menilai pose tertentu dengan mengira bilangan interaksi antara molekul yang menggalakkan.
Infografik berikut meringkaskan perbezaan antara dok molekul dan pemarkahan.
Ringkasan – Pelabuhan Molekul lwn Pemarkahan
Docking dan pemarkahan molekul penting dalam pemodelan molekul. Perbezaan utama antara dok molekul dan pemarkahan ialah dok ialah teknik yang digunakan untuk menentukan pertalian pengikatan antara dua molekul manakala pemarkahan ialah proses menilai pose tertentu dengan mengira bilangan interaksi antara molekul yang menggalakkan.
