Perbezaan Utama – Transposases Bakteria lwn Integrasi Retroviral
Bahan genetik yang boleh diangkut telah berkembang dengan dua strategi utama untuk bergerak dari satu rantau ke rantau seterusnya dalam dan antara genom. Satu kaedah adalah dengan menyesarkan melalui molekul RNA sebelum pembentukan molekul DNA manakala laluan lain melibatkan perantaraan DNA. Transposases dan integrasi virus adalah contoh bahan genetik boleh transpos tersebut. Transposases bakteria mengikat hujung transposon dan memudahkan pemangkinan pergerakan transposon ke bahagian lain genom melalui pelbagai mekanisme. Retroviral integrases ialah enzim yang membantu dalam integrasi bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel perumah yang dijangkitinya. Ini ialah perbezaan utama antara transposases bakteria dan integrasi retroviral.
Apakah Transposases Bakteria?
Transposase boleh ditakrifkan sebagai enzim yang terikat pada hujung transposon yang memudahkan pemangkinan pergerakan transposon ke bahagian lain genom melalui pelbagai mekanisme. Mekanisme tersebut termasuk 'mekanisme potong dan tampal' dan 'mekanisme transposisi replikatif'. Transposase mula diperkenalkan melalui pengklonan enzim yang diperlukan untuk transposisi transposon Tn3. Dua strategi penting telah digunakan oleh unsur genetik transposable untuk anjakan antara genom atau dari satu tapak ke tapak yang lain. Pengangkutan melalui perantaraan RNA sebelum sintesis salinan DNA adalah satu strategi manakala yang lain terikat kepada perantaraan DNA sahaja. Tindak balas penggabungan semula yang terlibat dalam penyepaduan kedua-dua unsur berlaku disebabkan oleh enzim khusus unsur. Oleh itu, dalam contoh unsur DNA, enzim ini dikenali sebagai transposases manakala dalam contoh unsur RNA, ia dikenali sebagai integrase.
Apabila membandingkan perbezaan antara kedua-dua strategi transposisi, proses pemasukan kelihatan sama secara kimia. Tetapi, bukti terkini mencadangkan bahawa persamaan tertentu dalam mekanisme integrasi dilihat di kawasan urutan asid amino yang membentuk tapak aktif; motif DDE. Lima keluarga transposase sedang diklasifikasikan pada masa ini tetapi, bilangan keluarga masih belum meningkat dengan aksara transposase baharu. Keluarga termasuk transposase DDE, Tyrosine (Y) transposase, Serine (S) transposase, Rolling circle transposase, Reverse transcriptases/endonucleases (RT/En) dsb. Keluarga ini menggunakan mekanisme pemangkin unik untuk pemecahan dan penyatuan semula DNA. Transposase DDE melibatkan mekanisme potong dan tampal transposon asal dan membawa tiga set asid amino terpelihara iaitu; aspartat (D), aspartat (D) dan glutamat (E). Transposases tirosin juga terlibat dalam mekanisme potong dan tampal dengan menggunakan sisa tirosin, yang khusus tapak.
Rajah 01: Transposases Bakteria
Transposases serine melibatkan perantaraan DNA bulat dan menjalankan mekanisme potong dan tampal sama seperti keluarga di atas. Transposase bulatan bergolek melibatkan mekanisme penyalinan di mana satu helai terus disalin ke tapak sasaran melalui replikasi DNA. Ini memastikan bahawa helai templat dan helai yang disalin mempunyai helai yang baru disintesis. Transkripase terbalik/endonucleases transposase mempunyai pelbagai mekanisme untuk transposisi.
Apakah itu Retroviral Integrases?
Dalam konteks Retroviral Integrase, ia dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu dalam integrasi bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. Integrasi retroviral ini paling kerap dikelirukan dengan integrasi fag. Contoh untuk integrase phage ialah λ phage integrase. Tetapi ini adalah enzim yang sama sekali berbeza dan tidak boleh dikelirukan. Berkenaan dengan pembentukan kompleks pra-integrasi retroviral, integrase retroviral memainkan peranan utama. Protein integrase retroviral biasanya terdiri daripada tiga (03) domain kanonik. Domain ini disambungkan oleh pemaut fleksibel.
Tiga domain termasuk domain pengikat zink terminal N di mana tiga berkas heliks disambungkan dan distabilkan melalui penyelarasan dengan penglibatan kation Zn2+, lipatan RNase H domain teras pemangkin dan domain pengikat DNA terminal C, yang merupakan lipatan SH3. Melalui penyiasatan dan melalui maklumat biokimia dan struktur, ia menunjukkan bahawa integrase retroviral mempunyai keupayaan untuk berfungsi sebagai dimer dimmer (tetramer). Dalam konteks multimerisasi dan pengikatan DNA virus, ketiga-tiga domain protein integrase retroviral. Fungsi utama integrase retroviral adalah untuk memasukkan bahan genetiknya ke DNA tuan rumah. Langkah ini adalah langkah paling penting dalam replikasi virus virus HIV. Setelah berjaya disepadukan, ia akan berada di dalam DNA kromosom sel sepanjang hayatnya.
Rajah 02: Integrasi Retroviral
Oleh itu, setelah disepadukan, tiada pulangan untuk sel. Integrasi retroviral ini melibatkan pemangkinan dua tindak balas utama termasuk pemprosesan akhir 3' dan pengikatan kovalen. Semasa pemprosesan hujung 3', 2-3 nukleotida dari kedua-dua hujung 3' DNA virus dikeluarkan dengan tujuan untuk mendedahkan dinukleotida CA pada hujung 3' DNA virus, dan semasa pengikatan kovalen, hujung 3' yang diproses DNA virus diikat secara kovalen ke dalam DNA kromosom perumah.
Apakah Persamaan Antara Transposases Bakteria dan Integrasi Retroviral?
Kedua-dua Transposases Bakteria dan Integrasi Retroviral mempunyai urutan asid amino yang serupa
Apakah Perbezaan Antara Transposases Bakteria dan Integrasi Retroviral?
Transposases Bakteria lwn Integrasi Retroviral |
|
| Transposase Bakteria ialah enzim yang terikat pada hujung transposon sambil memudahkan pemangkinan pergerakan transposon ke bahagian lain genom melalui pelbagai mekanisme. | Retroviral Integrases dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu dalam penyepaduan bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. |
| Kawasan Mengikat | |
| Kawasan pengikat khusus yang tinggi diperlukan untuk Transposases Bakteria. | Kurang atau tiada jujukan nukleotida diperlukan untuk pengikatan. |
Ringkasan – Transposases Bakteria lwn Integrasi Retroviral
Transposases bakteria dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu dalam integrasi bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. Dua strategi penting telah digunakan oleh unsur genetik transposable untuk anjakan antara genom atau dari satu tapak ke tapak yang lain. Lima keluarga transposase sedang diklasifikasikan pada masa ini tetapi, bilangan keluarga masih belum meningkat dengan aksara transposase baharu. Retroviral Integrase, ia dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu dalam integrasi bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. Protein integrase retroviral biasanya terdiri daripada tiga (03) domain kanonik. Fungsi utama integrase retroviral adalah untuk memasukkan bahan genetiknya ke DNA tuan rumah. Langkah ini adalah langkah paling penting dalam replikasi virus virus HIV. Oleh itu, apabila disepadukan, tiada pulangan untuk sel. Ini ialah perbezaan antara Transposases Bakteria dan Integrasi Retroviral.
Muat turun PDF Transposases Bakteria lwn Integrasi Retroviral
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam nota petikan. Sila muat turun versi PDF di sini: Perbezaan Antara Transposases Bakteria dan Integrasi Retroviral
