Agarose lwn Polyacrylamide
Agarose dan Polyacrylamide adalah kedua-duanya polimer larut air tetapi, di antara mereka, banyak perbezaan boleh dilihat, bermula dari asalnya. Kedua-dua Agarose dan Polyacrylamide mempunyai sesuatu yang biasa dalam keupayaan mereka untuk membentuk matriks gel berliang. Walaupun begitu, terdapat beberapa perbezaan yang berbeza antara keduanya. Perbezaan utama antara kedua-dua polimer ini terletak pada sifat asalnya, struktur kimia, kegunaannya yang berbeza dan prestasinya dari segi elektroforesis gel.
Apakah itu Agarose?
Agarose ialah polimer linear semulajadi yang seterusnya diperoleh daripada polimer kompleks yang dipanggil agar-agar yang terdapat dalam rumpai laut. Agarose diekstrak daripada agar dengan penyingkiran komponen proteinnya yang dipanggil agaropektin. Agarose adalah apa yang memberikan agar keupayaannya untuk membentuk gel.
Kegunaan utama agarose adalah dalam kajian mikrobiologi dan biologi molekul. Dalam kajian mikrobiologi, agarose, apabila ditambah dengan nutrien yang sesuai, menyediakan asas yang kukuh untuk memupuk mikroorganisma seperti bakteria dan kulat. Apabila digunakan pada kepekatan separa pepejal, ia boleh berguna dalam menilai motilitas mikroorganisma ini. Dalam biologi molekul, ia berfungsi sebagai alat penting untuk salah satu proses resolusi paling asas yang dipanggil 'gel electrophoresis' atau 'agarose gel electrophoresis' (AGE). Elektroforesis gel adalah proses yang membolehkan resolusi atau pemisahan asid nukleik atau protein berdasarkan saiz dan casnya. Di sini, agarose berfungsi sebagai gel seperti ayak berliang yang melaluinya pemisahan berlaku.
Struktur Agarose
Apakah itu Poliakrilamida?
Polyacrylamide ialah polimer sintetik dan digunakan dalam pelbagai jenis industri. Seperti yang dinyatakan sebelum ini, penggunaannya bergantung pada keupayaannya untuk membentuk gel. Walau bagaimanapun, sebagai tambahan kepada ini, keupayaannya untuk menyimpan dan mengalirkan air pada kepekatan yang berbeza juga dieksploitasi dalam pelbagai industri.
Penggunaan poliakrilamida yang paling meluas dan biasa adalah dalam rawatan air sisa. Di sini, ia digunakan sebagai agen pemberbukuan untuk mengeluarkan sebarang bahan organik terampai; oleh itu, memperbaiki kekeruhan dan menjernihkan air. Satu lagi kegunaan polyacrylamide adalah dalam industri kertas. Di sini, ia digunakan sama ada untuk menyimpan atau mengalirkan air daripada pulpa kertas mengikut keperluan. Begitu juga, dalam industri pertanian dan pembinaan, ia digunakan sebagai perapi tanah untuk mengelakkan hakisan tanah dan meningkatkan kualitinya.
Seperti agarose, poliakrilamida juga digunakan dalam biologi molekul sebagai alat resolusi penting dalam proses serupa yang dipanggil 'Polyacrylamide gel electrophoresis' (PAGE). Sebagai tambahan kepada semua ini, Polyacrylamide juga digunakan dalam pemprosesan bijih dan pembuatan agen pemberbukuan untuk mengeluarkan sebarang bahan organik terampai; oleh itu, memperbaiki kekeruhan dan menjernihkan air. Satu lagi kegunaan polyacrylamide adalah dalam industri kertas. Di sini, ia digunakan sama ada untuk menyimpan atau mengalirkan air daripada pulpa kertas mengikut keperluan. Begitu juga dalam industri pertanian dan pembinaan, ia digunakan sebagai perapi tanah untuk mengelakkan hakisan tanah dan meningkatkan kualitinya. Sebagai tambahan kepada semua ini, Poliakrilamida juga digunakan dalam pembuatan bahan tambahan makanan, kanta sentuh lembut dan tekstil.
Struktur Poliakrilamida
Apakah perbezaan antara Agarose dan Poliakrilamida?
Asal Asal Agarose dan Poliakrilamida:
Agarose: Agarose ialah polimer asal semula jadi. Ia berasal daripada rumpai laut.
Polyacrylamide: Poliakrilamida berasal dari sintetik dan tidak ditemui dalam sebarang keadaan semula jadi.
Formula Molekul Agarose dan Poliakrilamida:
Agarose: Formula molekul agarose ialah C24H38O19.
Polyacrylamide: Formula molekul poliakrilamida ialah (C 3H5NO)n.
Struktur Kimia Agarose dan Poliakrilamida:
Agarose: Agarose ialah polisakarida linear. Ia terdiri daripada unit disakarida berulang yang dipanggil agrobiose yang disatukan oleh ikatan hidrogen.
Polyacrylamide: Polyacrylamide ialah polimer bersilang secara kimia. Ia terdiri daripada monomer akrilamida dan agen penghubung silang N, N’-methylenebisacrylamide.
Ketoksikan Agarose dan Poliakrilamida:
Agarose: Kedua-dua agarose dan unit monomernya agrobiose tidak bersifat toksik.
Polyacrylamide: Unit monomer poliakrilamida, akrilamida, adalah dianggap karsinogen dan neurotoksin yang diketahui manakala bentuk terpolimernya tidak bersifat toksik.
Ciri-ciri Gel Agarose dan Poliakrilamida:
UMUR dan HALAMAN:
Agarose: Penyediaan gel agarose untuk AGE kurang memakan masa, mudah dan ringkas serta tidak memerlukan pemangkin pemula atau pempolimeran.
Polyacrylamide: Penyediaan gel poliakrilamida untuk PAGE memakan masa dan membosankan dan juga memerlukan pemula (ammonium persulphate) dan pemangkin pempolimeran (N, N, N', N'-tetramethylethylendiamine – TEMED).
Alam Semulajadi:
Gel poliakrilamida secara kimia lebih stabil daripada gel agarose.
Saiz Liang:
Memandangkan kepekatan yang sama, matriks gel poliakrilamida cenderung mempunyai saiz liang yang lebih kecil berbanding dengan matriks gel agarose.
Mengubah Saiz Liang:
Saiz liang gel poliakrilamida boleh diubah dengan cara yang lebih terkawal berbanding gel agarose.
Kuasa Menyelesaikan:
Gel poliakrilamida mempunyai kuasa penyelesaian yang tinggi manakala gel agarose mempunyai kuasa penyelesaian yang rendah.
Menampung Asid Nukleik:
Gel poliakrilamida boleh menampung kuantiti asid nukleik yang lebih besar daripada gel agarosa untuk cara penyelesaian.
