Perbezaan utama antara elektroforesis gel agarose dan poliakrilamida ialah elektroforesis gel agarose menggunakan gel agarosa yang dituangkan secara mendatar untuk memisahkan serpihan DNA yang lebih besar, manakala elektroforesis gel poliakrilamida menggunakan gel poliakrilamida yang dituangkan secara menegak untuk memisahkan serpihan asid nukleik yang lebih pendek.
Elektroforesis ialah sejenis teknik yang menggunakan medan elektrik yang digunakan pada matriks gel untuk memisahkan biomolekul seperti DNA, RNA dan protein. Pemisahan biomolekul seperti DNA, RNA, dan protein melalui elektroforesis adalah berdasarkan cas dan saiz. Sampel dimasukkan ke dalam telaga gel. Kemudian, medan elektrik digunakan merentasi gel. Medan menyebabkan molekul bercas negatif bergerak ke arah elektrod positif. Matriks gel bertindak sebagai penapis molekul yang melaluinya molekul terkecil melepasi atau bergerak dengan pantas manakala molekul yang lebih besar bergerak perlahan. Ini membolehkan pemisahan molekul berdasarkan cas dan saiz. Oleh itu, elektroforesis gel agarose dan poliakrilamida ialah dua jenis teknik elektroforesis gel yang terutamanya membantu mengasingkan molekul berdasarkan saiz dan casnya.
Apakah itu Elektroforesis Gel Agarose?
Elektroforesis gel agarose ialah teknik yang menggunakan gel agarose untuk memisahkan biomolekul seperti DNA dan RNA. Ia adalah teknik yang digunakan untuk memisahkan asid nukleik terutamanya mengikut saiz. Sebatian utama yang dipanggil agarose yang digunakan dalam teknik ini ialah polisakarida. Ia berasal dari rumpai laut. Agarose boleh dilarutkan dalam penimbal mendidih dan kemudian boleh dituangkan ke dalam dulang yang disimpan secara melintang. Dalam dulang, ia menjadi pepejal apabila ia sejuk untuk membentuk papak. Gel agarose dituangkan dengan sikat di tempatnya untuk membuat telaga di mana asid nukleik seperti DNA atau RNA dimuatkan sebaik sahaja gel telah menjadi pejal.
Rajah 01: Elektroforesis Gel Agarose
Gel kemudiannya direndam dalam penimbal yang sesuai, dan arus dikenakan merentasi gel. DNA mempunyai cas negatif seragam yang bebas daripada komposisi jujukan molekul. Oleh itu, molekul DNA akan berhijrah dari katod (-) ke arah anod (+). Kadar migrasi secara langsung bergantung kepada saiz molekul. Makromolekul terbesar mempunyai masa yang paling sukar untuk menavigasi melalui gel. Sebaliknya, makromolekul yang lebih kecil menyelinap melalui gel dengan cepat dan agak mudah.
Apakah itu Polyacrylamide Gel Electrophoresis?
Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) ialah teknik yang menggunakan gel poliakrilamida untuk memisahkan biomolekul. Ia adalah teknik yang digunakan secara meluas untuk memisahkan makromolekul biologi, biasanya protein dan asid nukleik, mengikut mobiliti elektroforesisnya. Penghidratan akrilonitril menghasilkan pembentukan molekul akrilamida oleh nitril hidratase. Akrilamida larut dalam air, dan apabila penambahan pemula radikal bebas, akrilamida terpolimerisasi, mengakibatkan pembentukan gel poliakrilamida. Biasanya, peningkatan kepekatan akrilamida mengakibatkan saiz liang dalam gel berkurangan. Gel poliakrilamida dituangkan secara menegak, tidak seperti gel agarose.
Rajah 02: Elektroforesis Gel Poliakrilamida
Dalam elektroforesis gel poliakrilamida, molekul mungkin berjalan dalam keadaan asalnya, mengekalkan struktur molekul yang lebih tinggi. Kaedah ini dipanggil PAGE asli. Sebagai alternatif, denaturan kimia juga boleh ditambah untuk membuang struktur tertib lebih tinggi dan mengubah molekul menjadi molekul tidak berstruktur yang pergerakannya hanya bergantung pada panjangnya. Jenis ini dipanggil SDS-PAGE.
Apakah Persamaan Antara Agarose dan Elektroforesis Gel Poliakrilamida?
- Elektroforesis gel agarosa dan poliakrilamida ialah dua jenis teknik elektroforesis gel.
- Malah, ia adalah teknik biologi molekul.
- Kedua-dua teknik digunakan untuk mengesan makromolekul biologi seperti DNA dan protein.
- Teknik ini dilakukan oleh juruteknik atau penyelidik mahir.
- Dalam kedua-dua teknik, pemisahan makromolekul adalah berdasarkan cas dan saiz.
- Kedua-dua teknik membenarkan pemisahan asid nukleik seperti DNA dan RNA.
Apakah Perbezaan Antara Agarose dan Elektroforesis Gel Poliakrilamida?
Elektroforesis gel agarose ialah teknik yang menggunakan gel agarosa yang dituangkan secara mendatar untuk memisahkan biomolekul, manakala elektroforesis gel poliakrilamida ialah teknik yang menggunakan gel poliakrilamida yang dituangkan secara menegak untuk memisahkan biomolekul. Ini adalah perbezaan utama antara elektroforesis gel agarose dan polyacrylamide. Tambahan pula, elektroforesis gel agarose digunakan untuk pengasingan DNA dan RNA, manakala elektroforesis gel poliakrilamida digunakan untuk pengasingan asid nukleik seperti DNA, RNA atau protein.
Jadual berikut meringkaskan perbezaan antara elektroforesis gel agarose dan poliakrilamida.
Ringkasan – Agarose lwn Poliakrilamida Gel Elektroforesis
Elektroforesis gel agarose dan poliakrilamida ialah dua jenis teknik elektroforesis gel yang digunakan dalam makmal biologi molekul. Elektroforesis gel agarose menggunakan gel agarose untuk memisahkan biomolekul. Agarose secara amnya tidak toksik kepada manusia, manakala polyacrylamide adalah toksik kepada manusia. Selain itu, elektroforesis gel agarose menunjukkan resolusi rendah manakala elektroforesis gel poliakrilamida menunjukkan resolusi yang lebih. Elektroforesis gel poliakrilamida menggunakan gel poliakrilamida untuk memisahkan biomolekul. Ini meringkaskan perbezaan antara elektroforesis gel agarose dan poliakrilamida