Perbezaan utama antara MLVA dan MLST ialah MLVA menggunakan polimorfisme jujukan DNA berulang serentak untuk mencirikan spesies mikrob, manakala MLST menggunakan polimorfisme jujukan DNA serpihan dalaman berbilang gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikrob.
Taip mikrob biasanya digunakan untuk menentukan sumber dan laluan jangkitan. Ia mengesahkan atau menolak wabak. Penaipan mikrob juga mengesan penghantaran silang patogen yang berkaitan dengan penjagaan kesihatan dan mengenali strain virulen. Selain itu, penaipan mikrob menilai keberkesanan langkah kawalan spesies mikrob patogenik. MLVA dan MLST ialah dua teknik biologi molekul yang digunakan dalam penaipan mikrob.
Apakah itu MLVA?
Analisis VNTR lokus berbilang (MLVA) ialah kaedah biologi molekul yang menggunakan polimorfisme jujukan DNA berulang serentak untuk mencirikan spesies mikrob. Ia ialah kaedah yang digunakan untuk analisis genetik spesies mikrob tertentu.
Semasa langkah pertama MLVA, setiap lokus VNTR yang disasarkan dikuatkan oleh PCR dengan primer khusus rantau mengapit. Kemudian serpihan yang diperoleh adalah saiz yang dipisahkan oleh elektroforesis pada penjujukan kapilari. Genotaip setiap lokus dan keputusan yang disusun daripada setiap sampel membolehkan mencirikan mikroorganisma yang spesiesnya diketahui. Ia juga membolehkan mengenal pasti subspesies melalui penaipan alel dan perbandingan dengan pangkalan data MLVA.
Rajah 01: MLVA
Kaedah MLVA ini lebih selektif daripada kaedah MLST. Tambahan pula, kaedah MLVA tidak memerlukan langkah penjujukan DNA. Oleh itu, ia memungkinkan untuk membezakan subspesies rapat atau spesies klon.
Apakah itu MLST?
Penaipan jujukan berbilang lokus (MLST) ialah teknik yang menggunakan polimorfisme jujukan DNA serpihan dalaman berbilang gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikrob. MLST ialah teknik dalam analisis genetik untuk menaip lokus berbilang.
Rajah 02: MLST
Ia adalah sejenis penaipan jujukan yang digunakan sebagai teknik rujukan untuk membezakan strain spesies mikrob yang berbeza. Kaedah ini adalah berdasarkan penjujukan gen pengemasan. Gen pengemasan biasanya mengekod protein penting agen mikrob seperti bakteria. Urutan gen pengemasan ini mempunyai keistimewaan untuk membentangkan polimorfisme yang stabil dari semasa ke semasa. Oleh itu, perbezaan dalam urutan gen pengemasan cukup mencukupi untuk membezakan strain antara satu sama lain. Tambahan pula, skim MLST pertama yang dibangunkan ialah Neisseria meningitidis, agen penyebab meningitis meningokokus dan septikemia. Sejak diperkenalkan, MLST telah digunakan bukan sahaja untuk patogen manusia tetapi juga untuk patogen tumbuhan.
Apakah Persamaan Antara MLVA dan MLST?
- MLVA dan MLST ialah dua teknik biologi molekul yang digunakan dalam menaip mikrob.
- Kedua-dua teknik boleh digunakan untuk analisis filogenetik mikrob.
- Kedua-dua teknik adalah berdasarkan polimorfisme genetik.
- Ia boleh digunakan untuk mengesan penyakit manusia yang menyebabkan patogen mikrob.
- Kedua-dua teknik harus dilakukan oleh ahli biologi molekul yang mahir.
Apakah Perbezaan Antara MLVA dan MLST?
MLVA ialah teknik yang menggunakan polimorfisme jujukan DNA berulang serentak untuk mencirikan spesies mikrob. Sementara itu, MLST ialah teknik yang menggunakan polimorfisme jujukan DNA serpihan dalaman berbilang gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikrob. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara MLVA dan MLST. Tambahan pula, kaedah MLVA lebih selektif berbanding kaedah MLST.
Maklumat di bawah menunjukkan perbezaan antara MLVA dan MLST dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – MLVA lwn MLST
MLVA dan MLST ialah dua teknik biologi molekul yang digunakan dalam menaip mikrob. MLVA menggunakan polimorfisme jujukan DNA yang diulang secara serentak untuk mencirikan spesies mikrob, manakala MLST menggunakan polimorfisme jujukan DNA serpihan dalaman berbilang gen pengemasan untuk mencirikan spesies mikrob. Jadi, ini ialah perbezaan utama antara MLVA dan MLST.
