Perbezaan utama antara T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase ialah T4 DNA ligase ialah enzim yang diasingkan daripada bakteriofaj T4 manakala E. coli DNA ligase ialah enzim yang diasingkan daripada bakteria E. coli.
DNA ligase ialah sejenis enzim khusus yang memudahkan penyambungan untaian DNA bersama melalui pembentukan ikatan fosfodiester. Ia memainkan peranan penting dengan membaiki patah rantai tunggal dan patah rantai ganda dalam DNA organisma hidup. Selain itu, ligase DNA digunakan dalam kedua-dua pembaikan DNA dan replikasi DNA. Selain daripada penggunaan di atas, DNA ligase juga mempunyai penggunaan yang meluas dalam eksperimen biologi molekul seperti teknologi DNA rekombinan. Ligase DNA T4 dan ligase DNA E. coli ialah dua jenis enzim ligase DNA.
Apakah T4 DNA Ligase?
T4 ligase ialah enzim penyambung DNA yang diasingkan daripada bakteriofaj T4. T4 bacteriophage ialah virus yang menjangkiti Escherichia coli. Enzim ligase T4 ialah ligase DNA yang paling biasa digunakan dalam penyelidikan makmal biologi molekul. Biasanya, ligase T4 memangkinkan penyatuan dua helai DNA untai dua yang padu atau tumpul antara kumpulan 5’ fosfat dan 3’ hidroksil nukleotida bersebelahan. Ia juga boleh memangkinkan penyambungan RNA kepada sama ada untaian DNA atau RNA dalam molekul dupleks. Walau bagaimanapun, enzim ini tidak akan bergabung dengan asid nukleik beruntai tunggal. Selain itu, ia juga boleh mengikat DNA hujung tumpul dengan kecekapan yang lebih besar daripada ligase DNA E. coli.
Rajah 01: Ligase DNA T4
Enzim ini memerlukan ATP sebagai kofaktor. Beberapa eksperimen penyelidikan kejuruteraan genetik telah menghasilkan enzim ligase DNA yang lebih aktif daripada ligase DNA T4 jenis liar. Dalam salah satu pendekatan, mereka mencipta molekul enzim gabungan dengan menggabungkan ligase DNA T4 kepada molekul p50 atau NF-kB. Enzim ligase T4 baharu ini 160% lebih aktif dalam ligan hujung tumpul untuk tujuan pengklonan daripada ligase DNA T4 jenis liar. Tambahan pula, suhu optimum untuk ligase DNA T4 untuk memangkinkan tindak balas pengikatan dengan lebih tepat ialah 16 °C.
Apakah E Coli DNA Ligase?
E. coli DNA ligase ialah enzim yang diasingkan daripada bakteria E. coli. Gen yang bertanggungjawab untuk membuat ligase DNA E. coli ialah gen lig. DNA E. coli, ligase serta kebanyakan ligase DNA prokariot, menggunakan tenaga yang diperolehi oleh NAD (nicotinamide adenine dinucleotide) untuk mencipta ikatan fosfodiester.
Rajah 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA ligase ialah enzim pengikatan yang boleh bergabung dengan serpihan DNA dengan memangkinkan pembentukan ikatan fosfodiester antara serpihan DNA bertali dua yang mengandungi 5’ fosfat termini dan 3’ hidroksil termini. Selain itu, ia tidak mengikat DNA hujung tumpul kecuali dalam keadaan khas seperti kesesakan molekul dengan polietilena glikol. Ia juga tidak boleh menggabungkan RNA kepada DNA dengan cekap. Tambahan pula, aktiviti ligase DNA E. coli boleh dipertingkatkan dengan kehadiran polimerase DNA 1 pada kepekatan yang betul. Walau bagaimanapun, apabila kepekatan enzim DNA polimerase 1 lebih tinggi, ia mempunyai kesan buruk terhadap aktiviti ligase DNA E. coli.
Apakah Persamaan Antara Ligase DNA T4 dan Ligase DNA E Coli?
- T4 DNA ligase dan E-coli DNA ligase ialah dua jenis enzim DNA ligase.
- Kedua-duanya adalah protein yang terdiri daripada asid amino.
- Enzim ini memangkinkan pembentukan ikatan fosfodiester antara 5’ fosfat dan 3’ hidroksil termini dalam DNA dupleks.
- Ia mempunyai kegunaan meluas dalam eksperimen biologi molekul seperti teknologi DNA rekombinan.
Apakah Perbezaan Antara Ligase DNA T4 dan Ligase DNA E Coli?
T4 DNA ligase ialah enzim yang diasingkan daripada bakteriofaj T4 manakala E. coli DNA ligase ialah enzim yang diasingkan daripada bakteria E. coli. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase. Tambahan pula, sumber tenaga untuk ligase DNA T4 ialah ATP. Sebaliknya, sumber tenaga untuk E. coli DNA ligase ialah NAD.
Maklumat di bawah menunjukkan perbezaan antara ligase DNA T4 dan ligase DNA E coli dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – Ligase DNA T4 lwn Ligase DNA E Coli
T4 DNA ligase dan E. coli DNA ligase ialah dua enzim yang memangkinkan pembentukan ikatan fosfodiester antara 5’ fosfat dan 3’ hidroksil termini dalam DNA dupleks. Ligase T4 ialah enzim yang diasingkan daripada bakteriofaj T4 manakala E. coli DNA ligase ialah enzim yang diasingkan daripada bakteria E. coli. Jadi, ini ialah perbezaan utama antara T4 DNA ligase dan E coli DNA ligase.
