Perbezaan utama antara SF1 dan SF2 ialah keupayaannya untuk melepaskan asid nukleik. Walaupun SF1 hanya melepaskan DNA, SF2 membuka kedua-dua DNA dan RNA.
Helikase ialah salah satu enzim utama yang mengambil bahagian dalam proses replikasi DNA serta dalam proses pembaikan DNA. Peranan utama helikase adalah untuk mengambil bahagian dalam proses pelepasan untuk memudahkan pemisahan molekul DNA beruntai dua. Aktiviti enzim adalah penting semasa fasa permulaan replikasi DNA. Helikas dibahagikan sebagai Super Family 1 dan Super Family 2 terutamanya berdasarkan perbezaan strukturnya. Dalam setiap Keluarga Super, terdapat lebih banyak jenis helikas yang pelbagai.
Apakah itu SF1?
Helikase Super Family 1 ialah sejenis helikas yang terdiri daripada struktur heksamerik bersama-sama protein teras dalaman, yang menggambarkan aktiviti helikas. Helikas SF1 ialah salah satu kelas helikas terbesar dan boleh dikategorikan lagi sebagai helikas SF1A dan helikas SF1B. Protein seperti PcrA, Rep dan UvrD, tergolong dalam kelas helikas SF1A. Sebagai perbandingan, protein seperti RecA dan Dda tergolong dalam kelas helikas SF1B. Fungsi helikas SF1 berbeza-beza. Beberapa fungsi penting helikas SF1 termasuk replikasi DNA, penggabungan semula DNA, pemprosesan serpihan Okazaki, pembentukan telomere, dan pembaikan eksisi nukleotida kerosakan DNA. Dalam sesetengah spesies bakteria, jenis helikas SF1 juga mengambil bahagian dalam membantu pemindahan gen mendatar melalui konjugasi. Tambahan pula, dalam virus, helikas SF1 membantu dalam replikasi virus.
Rajah 01: Tindakan Helicase
Terdapat banyak motif berbeza yang dikaitkan dengan struktur helikas SF1. Ia mengandungi sekurang-kurangnya 7 motif terpelihara antara semua jenis helikas SF1 yang berbeza (Q, I, Ia, II, III, IV, V dan VI). Struktur helikase SF1 adalah kristal, di mana motifnya dikelompokkan bersama. Terdapat poket pengikat ATP ciri di antara motif dan tapak pengikatan DNA. Domain tidak terpelihara diedarkan untuk mengekalkan integriti struktur molekul helikase. Domain ini mungkin berbeza antara helikas SF1A dan helikas SF1B.
Apakah itu SF2?
Helikas keluarga super 2 ialah salah satu kumpulan superfamili helikas yang paling pelbagai. Terdapat banyak jenis helikas SF2 seperti helikas seperti RecQ, helikas RecG – seperti helikas, Rad3/XPD dan helikas NS3. Beberapa enzim sekatan, seperti enzim sekatan jenis I, juga termasuk dalam kategori ini. Fungsi umum helikas SF2 ialah melepaskan DNA untai dua. Walau bagaimanapun, sesetengah jenis helikas SF2 tidak mempunyai keupayaan untuk bertindak sepenuhnya sebagai enzim helikase. Helikas SF2 digunakan secara meluas dalam pemprosesan RNA juga. Keluarga kotak DEAD helikas SF2 mengambil bahagian dalam pemprosesan RNA, termasuk transkripsi, penyambungan, pemprosesan terjemahan dan pemasangan kompleks protein RNA.
Rajah 02: Helikase
Struktur helikase SF2 juga mengandungi motif terpelihara. Walau bagaimanapun, sesetengah domain berbeza sedikit daripada helikase SF1. Ia juga mengandungi domain pengikat ATP selain daripada domain pengikatan DNA.
Apakah Persamaan Antara SF1 dan SF2?
- SF1 dan SF2 menunjukkan aktiviti helicase.
- Selain itu, kedua-duanya mengambil bahagian dalam replikasi dan penggabungan semula DNA.
- SF1 dan SF2 terdiri daripada motif yang dipelihara.
- Keduanya mempunyai domain mengikat ATP dan domain mengikat DNA.
- Bentuk ini ialah protein berbilang domain.
- Selain itu, jika mutasi berlaku dalam mana-mana jenis, ia akan mengakibatkan kesan yang merosakkan.
- Kedua-dua SF1 dan SF2 adalah penting untuk memastikan kesinambungan kitaran sel.
- SF1 dan SF2 terdapat dalam prokariot dan juga dalam eukariota.
Apakah Perbezaan Antara SF1 dan SF2?
SF1 dan SF2 ialah dua keluarga super helicase. Mereka menunjukkan kepelbagaian yang luas. Perbezaan utama antara SF1 dan SF2 ialah SF1 terutamanya terlibat dalam pelepasan DNA, manakala SF2 juga mengambil bahagian dalam pemprosesan RNA semasa transkripsi dan terjemahan. Apabila membandingkan motif protein yang berbeza, SF1 dan SF2 terutamanya berbeza berdasarkan motif III dan motif IV. Walaupun mereka mempunyai persamaan struktur, helikas SF1 membentuk struktur heksamerik toroidal manakala SF2 tidak membentuk susunan struktur ini.
Perbezaan lain antara SF1 dan SF2 ialah helikas SF1 lebih suka nukleotida adenin, manakala helikas SF2 lebih suka kelima-lima nukleotida untuk disasarkan untuk dilepaskan. Apabila membandingkan arah meleraikan, helikas SF1 hanya bertukar dalam arah 5’ hingga 3’, manakala helikas SF2 mempunyai keupayaan untuk translokasi bersama-sama dengan asid nukleik dalam kedua-dua arah.
Maklumat di bawah menunjukkan perbezaan antara SF1 dan SF2 dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – SF1 lwn SF2
Helikas ialah kumpulan enzim yang sangat penting dan pelbagai yang mengambil bahagian dalam replikasi DNA. Walau bagaimanapun, disebabkan kepelbagaian yang tinggi, enzim dikategorikan kepada superfamili. SF1 dan SF2 ialah dua keluarga super helikas terbesar. Walaupun SF1 dikaitkan terutamanya dengan pemprosesan yang berkaitan dengan DNA, SF2 dikaitkan dengan kedua-dua pemprosesan DNA dan RNA. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara SF1 dan SF2. Tambahan pula, SF1 dan SF2 juga berbeza dalam susunan strukturnya kerana SF2 tidak membentuk struktur heksamerik. Mutasi dalam helikas SF1 dan SF2 akan membawa kepada perkembangan kanser berikutan disregulasi kitaran sel dan mekanisme penting lain seperti pembaikan DNA.
