Perbezaan utama antara persamaan dan identiti dalam penjajaran jujukan ialah persamaan ialah keserupaan (keserupaan) antara dua jujukan berbanding perbandingan manakala identiti ialah bilangan aksara yang sepadan dengan tepat antara dua jujukan berbeza.
Bioinformatik ialah bidang sains antara disiplin yang terutamanya melibatkan biologi molekul dan genetik, sains komputer, matematik dan statistik. Penjajaran jujukan adalah istilah utama dalam bioinformatik. Ia adalah prosedur di mana urutan DNA, RNA atau protein disusun untuk mengenal pasti kawasan persamaan yang merupakan akibat daripada hubungan fungsional, struktur atau evolusi antara jujukan. Pada penghujung penjajaran, mereka akan dibentangkan sebagai baris dalam matriks. Untuk menjajarkan aksara yang sama dalam coloum berturut-turut, celah yang disisipkan terdapat di antara sisa.
Apakah Persamaan?
Kesamaan dalam penjajaran jujukan ialah persamaan antara dua jujukan apabila dibandingkan. Fakta ini bergantung kepada identiti jujukan. Persamaan menggambarkan sejauh mana sisa diselaraskan. Oleh itu, jujukan yang serupa mengandungi sifat yang serupa. Dalam bioinformatik, persamaan ialah alat untuk menilai keserupaan antara dua protein.
Rajah 01: Kesamaan dalam Penjajaran Jujukan
Terdapat dua langkah utama untuk menyusun proses penjajaran. Langkah awal ialah penjajaran berpasangan, yang membantu mencari penjajaran optimum antara dua jujukan (termasuk jurang) menggunakan algoritma seperti BLAST, FastA dan LALIGN. Algoritma padanan mencari bilangan minimum operasi edit; in-dels dan penggantian untuk menjajarkan satu jujukan kepada jujukan yang lain. Selepas penjajaran berpasangan, adalah perlu untuk mendapatkan dua parameter kuantitatif daripada setiap perbandingan berpasangan. Ia adalah identiti dan persamaan.
Apakah itu Identiti?
Identiti dalam penjajaran jujukan ialah bilangan aksara yang sepadan dengan tepat antara dua jujukan berbeza. Oleh itu, jurang tidak dikira semasa menilai identiti. Pengukuran dianggap sebagai hubungan dengan urutan yang lebih pendek di antara kedua-dua jujukan. Ia secara signifikan membayangkan bahawa ia mempunyai kesan di mana identiti jujukan tidak transitif. Jika X=Y dan Y=Z, maka X tidak semestinya sama dengan Z. Ini disimpulkan dari segi ukuran jarak identiti.
Rajah 02: Identiti dalam Penjajaran Jujukan
Sebagai contoh, X mempunyai jujukan AAGGCTT, Y mempunyai jujukan AAGGC dan Z mempunyai jujukan AAGGCAT. Identiti antara X dan Y ialah 100% {5 nukleotida yang sama / min[panjang(X), panjang(Y)]}. Identiti antara Y dan Z juga 100%. Tetapi identiti antara X dan Z hanyalah 85% {(6 nukleotida identical / 7)}.
Apakah Persamaan Antara Kesamaan dan Identiti dalam Penjajaran Jujukan?
- Kedua-dua persamaan dan identiti ialah dua istilah yang kami gunakan dalam penjajaran jujukan.
- Selain itu, ia merujuk kepada persamaan antara dua jujukan.
- Selain itu, kami menyatakannya sebagai nilai peratusan.
Apakah Perbezaan Antara Kesamaan dan Identiti dalam Penjajaran Jujukan?
Persamaan dalam penjajaran memberitahu persamaan antara dua jujukan apabila dibandingkan manakala identiti dalam penjajaran jujukan memberitahu jumlah aksara yang sepadan dengan tepat antara dua jujukan berbeza. Oleh itu, ini ialah perbezaan utama antara persamaan dan identiti dalam penjajaran jujukan.
Ringkasan – Persamaan lwn Identiti dalam Penjajaran Jujukan
Penjajaran jujukan membantu mengenal pasti kawasan persamaan dalam DNA, RNA atau protein yang terhasil disebabkan oleh hubungan fungsi, struktur atau evolusi antara jujukan. Oleh itu, persamaan dan identiti adalah dua istilah utama dalam konteks penjajaran jujukan. Perbezaan utama antara kedua-dua istilah ini ialah persamaan ialah persamaan antara dua jujukan dalam perbandingan manakala identiti ialah bilangan aksara yang sepadan dengan tepat antara dua jujukan berbeza. Oleh itu, ini adalah ringkasan perbezaan antara persamaan dan identiti dalam penjajaran jujukan.
