Perbezaan utama antara penjujukan klon dengan klon dan penjujukan senapang patah terletak pada kaedah kelakuan mereka. Kaedah penjujukan klon dengan klon melibatkan pemetaan kromosom dan pengklonan sebelum penjujukan manakala klon dengan penjujukan senapang patah mengetepikan kedua-dua pemetaan kromosom dan langkah pengklonan semasa penjujukan.
Klon dengan penjujukan klon dan klon dengan penjujukan senapang patah ialah dua kaedah penjujukan genom zaman moden. Penjujukan klon dengan klon ialah kaedah penjujukan yang lebih dipercayai. Walau bagaimanapun, kaedah klon dengan penjujukan senapang patah adalah lebih cepat dan lebih murah. Artikel ini memfokuskan pada perbezaan halus antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah.
Apakah itu Klon oleh Penjujukan Klon?
Klon melalui penjujukan klon ialah kaedah penjujukan genom. Ia memerlukan pemetaan setiap kromosom sebelum pemisahan DNA. Selepas pemetaan, DNA harus dipecahkan kepada serpihan sepanjang 150 kilobasis. Serpihan ini kemudiannya bersedia untuk penjujukan. Langkah seterusnya ialah memasukkan serpihan DNA ke dalam Bakterial Artificial Chromosomes (BACs) dan kemudian ke dalam sel bakteria. Oleh kerana serpihan kini berada di dalam sel bakteria, setiap kali apabila bakteria membahagi, serpihan DNA yang dimasukkan juga membahagi dan menghasilkan banyak salinan yang sama. Kemudian, DNA klon bakteria individu dipecahkan kepada 500 pasangan asas serpihan panjang. Ia adalah serpihan yang lebih kecil dan bertindih. Seterusnya, penjujukan berlaku dengan penyisipan serpihan ini ke dalam vektor dengan urutan DNA yang diketahui. Bermula daripada jujukan vektor yang diketahui, jujukan diteruskan sehingga jujukan tidak diketahui.
Selepas menyelesaikan penjujukan, adalah perlu untuk mengenal pasti kawasan jujukan bertindih. Selepas itu, penyatuan serpihan berlaku untuk membentuk serpihan yang lebih besar yang mula-mula dibentangkan dalam BAC. Seterusnya, pemasangan serpihan yang lebih besar ke dalam kromosom berlaku mengikut peta genom.
Rajah 01: Klon oleh Penjujukan Klon
Kelebihan ketara klon melalui penjujukan klon ialah peta genom yang telah disediakan sebelumnya membantu pemasangan serpihan yang lebih besar yang boleh dipercayai. Tetapi, kelemahan kaedah penjujukan ini ialah ia memakan masa untuk menjana peta genom dan membuat klon. Walau bagaimanapun, ini adalah kaedah yang diutamakan semasa 'Projek Genom Manusia'.
Apakah itu Clone by Shotgun Sequencing?
Klon dengan penjujukan senapang patah ialah kaedah penjujukan yang memecahkan jujukan DNA secara rawak kepada banyak serpihan kecil dan menyusun semula jujukan dengan memerhati kawasan yang bertindih. Genom mamalia yang lebih besar sukar untuk mengklon jujukan dan dipasang. Ia disebabkan oleh kerumitan dan saiz strukturnya. Walaupun kaedah penjujukan klon melalui klon boleh dipercayai, ia mengambil masa yang lama untuk menyusun genom organisma kompleks. Oleh itu, klon dengan penjujukan senapang patah telah menjadi kaedah penjujukan yang lebih murah yang boleh dipercayai yang boleh dilakukan dengan lebih cepat. Oleh itu, saintis zaman moden bergantung pada kaedah penjujukan ini untuk menangani genom yang kompleks.
Rajah 02: Klon dengan Urutan Senapang patah
Semasa klon dengan kaedah penjujukan senapang patah, tiada pemetaan genom konvensional dan langkah pengklonan berlaku. Pada mulanya, keseluruhan genom dipecahkan kepada saiz yang berbeza-beza dari 20 kilobases hingga 300 kilobases. Seterusnya, penjujukan berlaku. Kemudian, menggunakan perisian komputer yang canggih, adalah perlu untuk memasang serpihan dengan melihat kawasan bertindih.
Klon dengan penjujukan senapang patah membantu mempertingkatkan ketepatan jujukan genom sedia ada. Kelebihan utama kaedah ini ialah ia jauh lebih cepat dan lebih murah daripada kaedah penjujukan klon dengan klon. Walau bagaimanapun, proses ini tidak melibatkan penggunaan peta genetik. Oleh itu, kesilapan semasa pemasangan lebih berkemungkinan berlaku. Oleh itu, ini adalah kelemahan utama dalam klon dengan kaedah penjujukan senapang patah.
Apakah Persamaan Antara Klon oleh Penjujukan Klon dan Penjujukan Senapang patah?
- Kedua-dua klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah ialah dua kaedah penjujukan genom.
- Semasa kedua-dua teknik penjujukan, pemasangan serpihan yang dipecahkan berlaku dengan mengenal pasti kawasan bertindih.
- Selain itu, pecahan DNA kepada serpihan yang lebih kecil diperlukan untuk penjujukan klon dan senapang patah.
Apakah Perbezaan Antara Klon mengikut Penjujukan Klon dan Penjujukan Senapang patah?
Klon melalui teknik penjujukan klon melibatkan dua langkah utama: pemetaan kromosom dan pengklonan. Sebaliknya, klon dengan penjujukan senapang patah tidak mengikut dua langkah ini; ia secara rawak memecahkan jujukan DNA kepada banyak serpihan kecil dan menyusun semula jujukan dengan memerhati kawasan yang bertindih. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah. Disebabkan faktor ini, penjujukan klon dengan klon adalah proses yang mahal dan memakan masa manakala klon dengan penjujukan senapang patah lebih cepat dan murah.
Walau bagaimanapun, ralat semasa pemasangan kurang berkemungkinan berlaku semasa klon oleh penjujukan klon. Oleh itu, ia mempunyai kebolehpercayaan yang tinggi. Walau bagaimanapun, pengklonan dengan penjujukan senapang patah secara perbandingan adalah teknik yang kurang dipercayai. Jadi, ini juga merupakan perbezaan ketara antara penjujukan klon dengan klon dan penjujukan senapang patah.
Maklumat-grafik di bawah membentangkan lebih banyak maklumat mengenai perbezaan antara klon mengikut penjujukan klon dan penjujukan senapang patah.
Ringkasan – Klon oleh Penjujukan Klon lwn Penjujukan Senapang patah
Dalam meringkaskan perbezaan antara penjujukan klon dengan klon dan penjujukan senapang patah, penjujukan klon dengan klon dan penjujukan senapang patah ialah dua kaedah penjujukan genom. Walau bagaimanapun, teknik penjujukan klon dengan klon melibatkan kedua-dua pemetaan genom dan proses pengklonan manakala klon dengan penjujukan senapang patah tidak. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara penjujukan klon dengan klon dan penjujukan senapang patah. Memandangkan pemetaan genom berlaku semasa penjujukan klon dengan klon, ralat kurang berkemungkinan berlaku semasa pemasangan jujukan. Tetapi, klon dengan penjujukan senapang patah adalah proses yang lebih cepat dan lebih murah. Namun, ia agak kurang boleh dipercayai. Penjujukan klon dengan klon adalah kaedah penjujukan pilihan semasa 'Projek Genom Manusia'. Tetapi, ahli biologi molekul zaman moden lebih bergantung pada klon dengan penjujukan senapang patah.
