Perbezaan utama antara penjujukan genom keseluruhan dan penjujukan exome ialah keseluruhan penjujukan genom menyusun keseluruhan genom organisma manakala penjujukan exome hanya menyusun exome atau gen pengekodan protein bagi organisma.
Penjujukan ialah teknik yang menentukan susunan nukleotida yang tepat dalam molekul DNA tertentu. Ia hanya mencerminkan susunan yang betul bagi empat asas; adenina (A), guanina (G), sitosin (C) dan timin (T) dalam serpihan DNA. Terdapat beberapa kaedah penjujukan seperti penjujukan Sanger, penjujukan generasi akan datang, dsb. Tambahan pula, sama ada genom lengkap organisma (jujukan genom keseluruhan) atau hanya gen pengekodan protein dalam genom (jujukan exome) boleh menjalani penjujukan.
Apakah Penjujukan Seluruh Genom?
Genom manusia mengandungi hampir tiga bilion pasangan asas DNA. Penjujukan genom keseluruhan ialah kaedah yang menyusun genom lengkap sesuatu organisma. Oleh itu, dalam penjujukan genom keseluruhan, pertimbangan adalah pada keseluruhan koleksi molekul DNA termasuk exomes, intron, ruang intergenik, dll. Selain itu, keseluruhan jujukan penjujukan genom bukan sahaja genom yang berada di dalam nukleus tetapi juga DNA mitokondria..
Rajah 01: Penjujukan Seluruh Genom
Dalam menyediakan penjujukan ini, langkah pertama ialah mengekstrak keseluruhan DNA. Kemudian, DNA yang diekstrak menjalani prosedur penjujukan menggunakan kaedah penjujukan yang sesuai. Dengan menganalisis urutan yang terhasil, menggunakan alat bioinformatik, kita boleh mengetahui penyakit yang jarang berlaku, kanser, penyakit berjangkit, dsb.
Apakah itu Exome Sequencing?
Exome ialah sebahagian daripada genom yang mengandungi kira-kira 1.5% daripada genom, dan ia adalah koleksi ekson. Ekson ialah jujukan yang menyalin ke dalam mRNA dan kemudian kepada produk protein akhir. Oleh itu, penjujukan exome menyusun keseluruhan urutan pengekodan protein dalam genom. Penjujukan Exome mendedahkan gangguan genetik kerana kebanyakan gangguan genetik timbul disebabkan oleh mutasi gen pengekodan protein. Oleh itu, proses diagnostik gangguan genetik kerap menggunakan penjujukan exome sebagai kaedah untuk mendiagnosis penyakit. Selain itu, apabila membandingkan dengan keseluruhan aplikasi penjujukan genom untuk ujian genetik, penjujukan exome mengambil sedikit masa untuk digunakan dan lebih murah.
Rajah 02: Penjujukan Exome
Dalam penjujukan exome, pertama, adalah perlu untuk memilih hanya urutan pengekodan protein daripada jumlah DNA. Perhatikan bahawa manusia mempunyai kira-kira 180000 urutan pengekodan protein. Kemudian, exome disusun menggunakan kaedah penjujukan throughput tinggi.
Apakah Persamaan Antara Penjujukan Genom Seluruh dan Penjujukan Exome?
- Penjujukan Genom Keseluruhan dan Penjujukan Exome ialah dua aplikasi penjujukan.
- Kedua-dua kaedah berguna dalam menentukan susunan jujukan nukleotida yang betul dalam kedua-dua kaedah.
- Selain itu, bioinformatik membantu dalam kedua-dua teknik menganalisis data.
Apakah Perbezaan Antara Penjujukan Genom Seluruh dan Penjujukan Exome?
Penjujukan genom keseluruhan menyusun keseluruhan DNA genom sesuatu organisma, manakala penjujukan exome hanya menyusun jujukan pengekodan protein daripada genom. Oleh itu, ini adalah perbezaan asas antara penjujukan genom keseluruhan dan penjujukan exome. Selain itu, walaupun kedua-dua kaedah digunakan secara meluas untuk menentukan susunan yang betul bagi jujukan nukleotida, keseluruhan penjujukan genom adalah mahal dan memakan masa berbanding penjujukan exome.
Maklumat maklumat di bawah menjadualkan perbezaan antara penjujukan genom keseluruhan dan penjujukan exome.
Ringkasan – Penjujukan Genom Seluruh vs Penjujukan Exome
Penjujukan mendedahkan susunan tepat asas dalam serpihan DNA dan ia boleh sama ada penjujukan genom keseluruhan atau penjujukan exome. Di sini, keseluruhan penjujukan genom menyusun genom lengkap organisma manakala penjujukan exome hanya menyusun urutan pengekodan protein dalam genom. Memandangkan aplikasinya, keseluruhan penjujukan genom membantu dalam menganalisis penyimpangan genetik seperti variasi nukleotida tunggal, pemadaman, sisipan, dll. dalam keseluruhan genom manakala penjujukan exome membantu dalam mengesan penyakit genetik. Oleh itu, ini ialah perbezaan antara penjujukan genom keseluruhan dan penjujukan exome.
