Perbezaan utama antara penjujukan senapang patah hierarki dan genom keseluruhan ialah dalam penjujukan senapang patah hierarki, genom dipecahkan kepada serpihan yang lebih besar sebelum penjujukan manakala, dalam penjujukan senapang patah genom keseluruhan, keseluruhan genom dipecahkan kepada serpihan kecil untuk penjujukan..
Penjujukan ialah teknik penting dalam proses molekul, terutamanya dalam pengecaman spesies yang tepat. Malah, ia adalah teknik mengenal pasti susunan nukleotida yang tepat dalam gen atau genom. Terdapat banyak teknik untuk penjujukan. Sebahagian daripada ini termasuk Kaedah Maxam Gilbert, Kaedah Sanger dan kaedah Sanger automatik.
Apakah Penjujukan Senapang patah Hierarki?
Penjujukan Senapang patah Hierarki ialah satu kaedah penjujukan. Ia juga dipanggil 'jujukan atas-bawah'. Selanjutnya, kaedah ini terdiri daripada dua langkah: langkah pertama ialah penguatan genom, dan langkah kedua ialah pemecahan genom. Dalam kaedah ini, genom digunting menjadi serpihan besar terlebih dahulu. Ia diikuti dengan pengklonan serpihan besar ini kepada pelbagai perumah menggunakan vektor atau kromosom tiruan. Kemudian, vektor rekombinan ini disusun menjadi perpustakaan. Semasa penjujukan senapang patah, klon vektor rekombinan menjalani penjujukan secara individu. Serpihan dalam klon mengalami penghadaman sekatan untuk mengurangkan lagi saiz genom, dengan itu menjalani penjujukan.
Rajah 01: Urutan Senapang patah Hierarki
Semasa penjujukan senapang patah hierarki, ketulan besar serpihan perlu disusun mengikut urutan, sebelum penjujukan senapang patah. Ia berlaku dengan bantuan penanda molekul yang digabungkan semasa proses pengklonan.
Jujukan senapang patah hierarki mencipta peta gen resolusi rendah. Tetapi ia mencipta peta jujukan tersusun. Oleh itu, ia mengambil tempoh yang lebih lama daripada penjujukan langsung. Keseluruhan proses tertunda kerana penciptaan perpustakaan vektor rekombinan. Adakah ia juga satu teknik intensif buruh. Walau bagaimanapun, pada masa ini, teknik ini diautomatikkan untuk memudahkan kerja.
Apakah Penjujukan Senapang patah Genom Seluruh?
Penjujukan senapang patah genom keseluruhan ialah proses penjujukan satu langkah. Dalam proses ini, keseluruhan ricih genom berlaku terlebih dahulu. Berikutan ini, setiap serpihan kecil ini menjalani penjujukan secara rawak. Setelah selesai penjujukan, analisis jujukan berlaku. Semasa analisis jujukan, jujukan yang bertindih dialih keluar, dan analisis bukanlah proses yang tersusun. Oleh itu, pemasangan jujukan adalah proses yang kurang cekap berbanding dengan jujukan senapang patah hierarki. Walau bagaimanapun, proses penjujukan senapang patah genom keseluruhan adalah lebih pantas, dan analisis keseluruhan genom boleh berlaku pada satu kejadian.
Apakah Persamaan Antara Penjujukan Senapang patah Hierarki dan Seluruh Genom?
- Penjujukan senapang patah hierarki dan keseluruhan genom ialah dua pendekatan penjujukan.
- Kedua-duanya menjalani penjujukan Sanger atau kaedah penjujukan Sanger automatik.
- Mereka terlibat dalam penjujukan serpihan DNA dan RNA.
- Selain itu, kedua-dua kaedah adalah penting dalam diagnostik molekul dan tujuan penyelidikan.
- Pada masa ini, kedua-dua teknik adalah automatik atau berasaskan komputer.
- Kedua-dua teknik bergantung pada pemecahan genom.
Apakah Perbezaan Antara Penjujukan Senapang patah Hierarki dan Seluruh Genom?
Jujukan senapang patah hierarki menjana serpihan bersaiz lebih besar berbanding dengan jujukan senapang patah genom keseluruhan, yang berfungsi dengan serpihan kecil jujukan. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara penjujukan senapang patah genom hierarki dan keseluruhan. Selain itu, penjujukan senapang patah hierarki terdiri daripada dua langkah utama, manakala penjujukan senapang patah genom keseluruhan bergantung pada satu langkah utama.
Selain itu, satu lagi perbezaan antara penjujukan senapang patah hierarki dan keseluruhan genom ialah resolusi lebih tinggi dalam penjujukan senapang patah genom keseluruhan berbanding dengan penjujukan senapang patah hierarki.
Maklumat maklumat di bawah meringkaskan perbezaan antara penjujukan senapang patah hierarki dan keseluruhan genom.
Ringkasan – Urutan Senapang patah Genom Berhierarki lwn Keseluruhan
Penjujukan senapang patah hierarki dan genom keseluruhan ialah dua teknik untuk menyusun genom besar. Urutan senapang patah hierarki ialah proses penjujukan dua langkah di mana genom dipecahkan kepada serpihan yang lebih besar. Sebaliknya, penjujukan senapang patah genom keseluruhan ialah penjujukan satu langkah di mana genom dipecahkan kepada serpihan kecil dan disusun secara langsung. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara penjujukan senapang patah genom hierarki dan keseluruhan. Selain itu, aspek teknikal mungkin berbeza antara kedua-dua teknik.
