Perbezaan utama antara DNA genom dan pengasingan DNA plasmid ialah pengasingan DNA genomik menyasarkan pengekstrakan DNA genom manakala pengasingan DNA plasmid menyasarkan pengekstrakan DNA plasmid bakteria.
Pengasingan DNA ialah proses kimia yang digunakan untuk mengasingkan DNA daripada spesies yang berbeza atau daripada sampel yang berbeza. Pengasingan DNA adalah penting dalam teknik biologi molekul hiliran, seperti elektroforesis gel, tindak balas rantai polimerase dan teknik penjujukan DNA. Oleh itu, pengasingan DNA adalah proses kimia penting dalam kajian biologi molekul. Berdasarkan tujuan penyelidikan, kadangkala perlu untuk mengasingkan DNA genomik. Di samping itu, beberapa kajian memberi tumpuan kepada mengasingkan DNA plasmid daripada bakteria. Pengasingan DNA genom ialah proses mengasingkan DNA genom daripada sampel prokariotik atau eukariotik. Langkah-langkah pengasingan berbeza mengikut jenis sel di mana DNA diasingkan. Pengasingan DNA plasmid ialah proses mengasingkan DNA plasmid daripada sel bakteria. Berbanding dengan pengasingan DNA genom, proses keseluruhan adalah kompleks dalam pengasingan DNA plasmid.
Apakah itu Pengasingan DNA Genomik?
Pengasingan DNA genomik ialah proses mengekstrak keseluruhan DNA genomik sesuatu organisma. Proses khusus ini melibatkan tiga peristiwa utama. Mereka adalah, lisis sel atau lisis nuklear, degradasi protein atau proteolisis dan pemendakan DNA genomik. Langkah lisis mungkin berbeza mengikut jenis sel. Dalam prokariot, kerana terdapat dinding sel peptidoglikan, langkah pertama haruslah pecahan dinding sel. Sebaliknya, dalam eukariota, langkah lisis melibatkan pecahan membran plasma dan membran nuklear untuk mengeluarkan DNA ke bahagian luar. Sebaliknya, langkah khas adalah penting untuk melisiskan dinding sel tumbuhan dan kulat.
Rajah 01: Pengasingan DNA Genomik
Akibatnya, sebaik sahaja langkah lisis selesai, akhirnya DNA akan datang ke supernatan. Pada masa yang sama, degradasi protein juga berlaku dalam larutan kerana penambahan proteinase K. Langkah seterusnya ialah memisahkan DNA genomik dan protein terdegradasi antara satu sama lain. Oleh itu, protein terdegradasi dipisahkan dengan pemendakan yang membenarkan DNA genom kekal dalam supernatan. Selepas pemendakan protein, DNA genomik boleh dimendakan dan digantung semula dalam penimbal yang sesuai sehingga diperlukan untuk eksperimen.
DNA Genomik, iaitu DNA linear mengandungi semua maklumat genetik sesuatu organisma. Dalam erti kata lain, genom adalah bahan keturunan organisma hidup yang bertanggungjawab untuk semua aktiviti struktur dan fungsi sel. Ia terdiri daripada kedua-dua urutan DNA pengekodan dan bukan pengekodan. Apabila mengasingkan DNA genom, ia merangkumi keseluruhan genom organisma.
Apakah itu Pengasingan DNA Plasmid?
Pengasingan DNA Plasmid ialah proses pengasingan DNA yang istimewa dan lebih rumit. Plasmid ialah DNA ekstrachromosomal yang terdapat dalam kebanyakan sel bakteria. Mereka adalah DNA bulat yang tidak aktif yang menyokong bakteria untuk bertahan dalam keadaan persekitaran yang teruk. DNA plasmid terdiri daripada gen tahan khas yang memberikan kelebihan tambahan kepada bakteria seperti rintangan antibiotik, sifat virulensi dan sifat toksik.
Rajah 02: Pengasingan DNA Plasmid
Pengasingan DNA Plasmid juga melibatkan tiga proses utama; lisis sel, proteinolisis dan pemendakan DNA. Walaupun mekanisme pengasingan biokimia adalah serupa dengan pengasingan DNA genom, prosesnya lebih kompleks daripadanya. Proses lisis sel adalah proses yang paling penting dalam prosedur ini. Paling penting, DNA genomik dan DNA plasmid tidak boleh bercampur antara satu sama lain. Oleh itu, proses lisis yang lebih ringan dimasukkan ke dalam prosedur pengasingan DNA plasmid. Oleh itu, dalam kebanyakan prosedur pengasingan DNA plasmid menggunakan detergen; natrium dodesil sulfat untuk lisis sel.
Apakah Persamaan Antara DNA Genomik dan Pengasingan DNA Plasmid?
- DNA genomik dan pengasingan DNA Plasmid tertumpu pada pengekstrakan DNA organisma.
- Selain itu, kedua-duanya mengikuti proses keseluruhan yang sama termasuk lisis sel, degradasi protein dan pemendakan DNA.
- Selain itu, DNA yang terhasil daripada kedua-dua proses adalah penting untuk proses hiliran.
- Selain itu, kedua-dua proses pengasingan termasuk langkah-langkah untuk membersihkan dan menyimpan DNA di bawah keadaan penyimpanan yang ditetapkan.
- Selain itu, proteinase K digunakan dalam kedua-dua kaedah untuk merendahkan protein.
Apakah Perbezaan Antara DNA Genomik dan Pengasingan DNA Plasmid?
Pengasingan DNA genomik memfokuskan pada mengekstrak keseluruhan DNA genom organisma sasaran manakala pengasingan DNA plasmid memfokuskan pada mengasingkan hanya DNA plasmid daripada spesies bakteria tertentu. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid. Selain itu, satu lagi perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid adalah dalam prosedur. Pengasingan DNA genomik adalah prosedur yang kurang kompleks berbanding pengasingan DNA plasmid. Oleh itu, apabila mengasingkan DNA plasmid, adalah perlu untuk mengambil langkah berjaga-jaga untuk mengelakkan percampuran DNA genomik dan plasmid antara satu sama lain.
Infograohic di bawah memberikan butiran lanjut tentang perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid.
Ringkasan – DNA Genomik lwn Pengasingan DNA Plasmid
Pengasingan DNA ialah proses penting dalam teknik biologi molekul. Terdapat dua jenis DNA iaitu DNA genomik dan DNA plasmid (extra-chromosomal DNA). Berdasarkan keperluan tersebut, beberapa prosedur dijalankan untuk mengasingkan DNA genomik manakala beberapa prosedur memfokuskan untuk mengasingkan hanya DNA plasmid daripada bakteria. Oleh itu, langkah-langkah yang terlibat dalam kedua-dua proses berbeza sedikit antara satu sama lain. Walau bagaimanapun, proses keseluruhan adalah sama dalam kedua-dua pengasingan. DNA terpencil kedua-dua proses mempunyai kegunaan yang besar dalam proses hiliran seperti pengklonan, elektroforesis gel dan tindak balas rantai polimerase. Pada penghujung protokol pengasingan DNA genomik, keseluruhan DNA genom organisma boleh diasingkan sebagai produk akhir manakala pada penghujung protokol pengasingan DNA plasmid, DNA plasmid bakteria masing-masing boleh diasingkan sebagai produk akhir. Oleh itu, ini ialah perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid.
