Perbezaan Utama – Proteomics vs Transcriptomics
Teknologi omik ialah trend semasa, di mana biomolekul organisma yang berbeza dilihat sebagai koleksi keseluruhan berkaitan dengan sifat dan fungsinya. Teknologi omic mempunyai pelbagai aplikasi. Omik berbeza bagi sampel biologi termasuk genomik, proteomik, transkriptomi dan metabolomik. Proteomik melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. Ia ditakrifkan sebagai set semua protein yang dinyatakan dalam organisma, sifat struktur dan fungsinya. Set lengkap protein, oleh itu, membentuk proteom. Transcriptomik ialah kajian lengkap tentang semua molekul RNA utusan (mRNA) yang terdapat dalam organisma hidup. Oleh itu, transkriptomi berkaitan dengan gen yang secara aktif dinyatakan dalam organisma hidup. Jumlah set mRNA dalam organisma hidup dirujuk sebagai transkriptom. Perbezaan utama antara Proteomics dan Transcriptomics adalah berdasarkan jenis biomolekul. Dalam proteomik, jumlah set protein yang dinyatakan dalam organisma hidup dikaji manakala, dalam transkriptomi, jumlah mRNA organisma hidup dikaji.
Apakah itu Proteomics?
Istilah proteomik dicipta pada tahun 1995 dan pada mulanya ditakrifkan sebagai jumlah pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Dengan kemajuan dalam kajian proteomik, ia kemudiannya diubah suai untuk dianggap sebagai istilah payung di mana banyak bidang kajian dimasukkan. Pada masa ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksinya, pengubahsuaiannya, aplikasinya dan kepentingan protein dikaji. Oleh itu, banyak penyelidikan dijalankan dalam bidang proteomik pada masa ini.
Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan jumlah kandungan protein dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Selepas kejayaan ini, saintis beralih kepada mencirikan jumlah kandungan protein dalam haiwan seperti babi guinea dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.
Aplikasi Proteomics
Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik, kerana protein ialah molekul yang mengawal kebanyakan aktiviti kerana sifat pemangkin protein. Oleh itu, kajian protein keseluruhan dapat memberikan maklumat mengenai status kesihatan sesuatu organisma. Beberapa aplikasi ialah;
- Anotasi genom: Dengan mengkaji kandungan protein organisma, genom yang tepat yang bertanggungjawab untuk sebatian protein aktif boleh ditentukan. Dalam senario ini hasil daripada semua genomik, Transkriptom dan proteomik adalah penting.
- Pengenalpastian penyakit / Diagnostik: Proteomik digunakan dalam mengenal pasti keadaan penyakit, dengan membandingkan yang sihat dan berpenyakit
- Untuk menjalankan ekspresi protein yang dikaji semasa eksperimen.
- Pengubahsuaian protein dan kajian interaksi: Untuk menggunakan protein dalam keadaan in vitro atau dan dalam keadaan vivo, untuk menentukan keadaan penyimpanan protein yang diekstrak ini dan untuk mengkaji kelakuan protein dalam in vitro, in vivo dan in – kaedah silico.
Rajah 01: Proteomik
Terdapat teknik berbeza yang terlibat dalam proteomik
- Pengekstrakan jumlah protein dan mengasingkan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga boleh diasingkan menggunakan Kromatografi Cecair Berprestasi Tinggi (HPLC).
- Penjujukan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau spektrometri jisim.
- Setelah jujukan dikenal pasti, sifat struktur dan fungsi kandungan protein dianalisis menggunakan perisian berasaskan komputer dan alatan bioinformatik.
Apakah Transkripmik?
Istilah transkriptom dicipta baru-baru ini. The Transcriptomics ialah kajian tentang jumlah kandungan mRNA sesuatu organisma. Jumlah mRNA ialah DNA yang dinyatakan dalam organisma hidup atau sel. Koleksi lengkap mRNA dirujuk sebagai transkriptom.
Langkah-langkah ke arah menganalisis transkrip termasuk,
- Pengekstrakan RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi gel lajur dengan manik poli DT.
- Penjujukan mRNA telah dilakukan.
Teknologi Microarray ialah satu cara biasa untuk mengenal pasti transkrip organisma. Teknik microarray melibatkan plat probe dengan helai pelengkap transkriptom. Selepas penghibridan, mRNA yang terdapat dalam organisma atau sel boleh dicirikan.
Rajah 02: Teknik Transkripmik
Transkriptomics kini digunakan secara meluas dalam bidang perubatan. Diagnostik penyakit dan pemprofilan penyakit adalah bidang utama di mana Transkripmik digunakan. Dengan menganalisis transkrip organisma, mRNA asing boleh dikenal pasti, dan jika terdapat sebarang jangkitan, ia boleh dikenal pasti. RNA bukan pengekodan boleh diasingkan menggunakan teknologi transkriptik. Dan juga ekspresi gen di bawah tekanan persekitaran yang berbeza boleh dipantau.
Apakah Persamaan Antara Proteomik dan Transkripmik?
- Kedua-duanya membentuk sebahagian daripada konsep teknologi omic.
- Kedua-duanya digunakan dalam diagnostik penyakit dan pencirian penyakit sesuatu organisma.
- Kedua-dua kawasan kajian melibatkan pengekstrakan biomolekul, pengasingan biomolekul dan langkah penjujukan.
Apakah Perbezaan Antara Proteomik dan Transkripmik?
Protemik lwn Transkriptom |
|
| Proteomik melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. | Transcriptomics ialah kajian lengkap tentang semua molekul RNA (mRNA) utusan yang terdapat dalam organisma hidup. |
| Jenis Bio Molekul yang Dikaji | |
| Protein dikaji dalam proteomik. | mRNA dikaji dalam transkriptomi. |
| Faktor yang Dikaji | |
| Struktur, fungsi, interaksi, pengubahsuaian dan aplikasi protein dikaji dalam proteomik. | Struktur jujukan, interaksi dengan persekitaran dan aplikasi mRNA dikaji dalam transkriptomi. |
Ringkasan – Proteomics vs Transcriptomics
Omics memainkan peranan penting dalam bidang sains hayat. Proteomik merujuk kepada kajian proteom yang membentuk koleksi lengkap protein dalam sel atau organisma. Transkriptom merujuk kepada kajian transkriptom yang merupakan set lengkap DNA yang dinyatakan dalam bentuk mRNA. Dua bidang kajian, proteomik dan transkriptomi, diperolehi selepas pengenalan genomik dan kini digunakan secara meluas dalam diagnostik perubatan dan dalam pencirian dan pemeriksaan organisma. Ini ialah perbezaan antara proteomik dan transkriptomi.
Muat turun PDF Proteomics vs Transcriptomics
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam nota petikan. Sila muat turun versi PDF di sini: Perbezaan Antara Proteomik dan Transkripmik
