Perbezaan Utama – Exome vs Transkriptom
Gen mengandungi kawasan pengekodan dan bukan pengekodan di dalamnya. Urutan pengekodan dikenali sebagai ekson, dan urutan bukan pengekodan dikenali sebagai intron. Urutan nukleotida ekson gen mewakili kod genetik gen untuk mensintesis protein tertentu. Oleh itu, ekson kekal dalam molekul mRNA. Jumlah kawasan exon genom dikenali sebagai exome, dan ia merupakan bahagian penting genom. Kod genetik gen ditukar kepada kod genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk penghasilan protein. Keseluruhan molekul mRNA yang ditranskripsikan dalam sel atau populasi sel pada satu masa dikenali sebagai transkriptom. Perbezaan utama antara exome dan transkriptom ialah exome mewakili jujukan kawasan exon genom manakala transkriptom mewakili jumlah mRNA sel atau tisu pada masa tertentu.
Apakah itu Exome?
Gen terdiri daripada ekson, intron dan jujukan kawal selia. Exon ialah kawasan gen yang ditranskripsikan ke dalam urutan mRNA semasa transkripsi. Intron dan kawasan bukan pengekodan lain dialih keluar semasa transkripsi. Urutan nukleotida ekson menentukan kod genetik gen yang mensintesis protein khusus yang dikodkannya. Hanya ekson kekal dalam mRNA protein. Pengumpulan ekson dalam genom dikenali sebagai exome organisma. Ia mewakili sebahagian daripada genom yang dinyatakan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% daripada genom. Ia adalah bahagian pengekodan protein bagi genom manusia.
Rajah 01: Exome
Apakah itu Transkriptom?
Transkriptom ialah pengumpulan semua transkrip (RNA) pengekodan protein dan bukan pengekodan dalam tisu tertentu. Transkriptom mewakili pengumpulan jumlah molekul mRNA yang dinyatakan oleh gen dalam sel atau tisu. Transkriptom sel boleh diubah dengan transkriptom jenis sel lain. Transkriptom juga dinamik - ia berubah mengikut masa sebagai tindak balas kepada rangsangan dalaman dan luaran. Walaupun dalam tisu yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkriptom boleh berubah selepas beberapa minit.
Transkriptom berbeza daripada exome organisma. Transkriptom merangkumi hanya urutan exome yang dinyatakan. Walaupun exome sel kekal sama, transkriptom berbeza antara sel kerana ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau tisu. Hanya gen penting yang dinyatakan dalam sel dan tisu yang berbeza. Ekspresi gen ialah proses khusus jenis tisu atau sel. Ia dikawal oleh pelbagai faktor termasuk faktor persekitaran. Oleh itu, transkriptom boleh berbeza-beza mengikut keadaan persekitaran luaran.
Transkriptom digunakan sebagai prekursor untuk kajian proteomik. Semua protein diperoleh daripada jujukan mRNA. Pengubahsuaian translasi boleh mengakibatkan perubahan dalam protein. Walau bagaimanapun, transkripme menyediakan maklumat asas yang penting untuk kajian proteomik.
Rajah 02: Transkriptom sel stem embrio
Apakah perbezaan antara Exome dan Transkriptom?
Exome lwn Transcriptome |
|
| Exome ialah koleksi kawasan pengekodan protein gen. | Transkriptom ialah koleksi semua RNA yang ditranskripsi termasuk mRNA. |
| Sampel | |
| Exome dikaji menggunakan sampel DNA. | Transkriptom dikaji menggunakan sampel RNA. |
| Kaedah Kajian | |
| Penjujukan exome keseluruhan ialah kaedah mempelajari exome. | Penjujukan RNA ialah kaedah mengkaji transkriptom. |
Ringkasan – Exome lwn Transcriptome
Exon ialah jujukan pengekodan gen dan menentukan jujukan mRNA bagi protein. Pengumpulan jujukan pengekodan (exon) ini dikenali sebagai exome organisma. Gen ditranskripsikan ke dalam molekul mRNA sebelum membuat protein. Jumlah molekul mRNA sel atau tisu pada bila-bila masa dikenali sebagai transkriptom. Transkriptom mewakili gen yang sedang aktif diekspresikan ke dalam mRNA pada bila-bila masa. Transkriptom adalah khusus sel dan tisu dan mempengaruhi keadaan persekitaran. Ini ialah perbezaan antara exome dan transkriptom.
