Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik

Isi kandungan:

Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik
Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik

Video: Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik

Video: Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik
Video: Genomik, transkritomik, proteomik dan metabolomik 2024, November
Anonim

Perbezaan utama antara proteomik dan metabolomik ialah proteomik ialah kajian semua protein organisma manakala metabolomik ialah kajian semua metabolit organisma.

Genomik ialah kajian tentang susunan genetik sesuatu organisma. Proteomik dan metabolomik adalah dua sains omik yang berkaitan dengan genomik. Proteome merujuk kepada semua protein dalam sel atau organisma. Metabolom, sebaliknya, merujuk kepada semua metabolit organisma. Oleh itu, kajian proteom adalah proteomik manakala kajian metabolom adalah metabolomik. Kedua-dua proteomik dan metabolomik adalah penting dalam diagnostik penyakit dan dalam pencirian dan pemeriksaan organisma. Selain itu, kedua-duanya disambungkan dalam banyak aspek biologi sel, terutamanya dalam isyarat sel, degradasi dan penjanaan protein serta pengubahsuaian selepas terjemahan.

Apakah itu Proteomics?

Proteome ialah jumlah pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Oleh itu, proteomik ialah kajian tentang proteom sesuatu organisma. Dalam proteomik, ciri-ciri protein yang berbeza dianalisis. Oleh itu, proteomik terutamanya memberi tumpuan kepada struktur, orientasi, fungsi, interaksi protein, pengubahsuaian, aplikasi dan kepentingan protein. Itulah sebabnya banyak projek penyelidikan dijalankan dalam bidang proteomik pada masa ini.

Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan jumlah kandungan protein dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Selepas kejayaan projek ini, saintis beralih kepada mencirikan jumlah kandungan protein dalam haiwan seperti babi guinea dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik kerana protein adalah molekul yang mengawal kebanyakan aktiviti kerana sifat pemangkin protein. Oleh itu, kajian protein keseluruhan dapat memberikan maklumat mengenai status kesihatan sesuatu organisma. Selain itu, proteomik mempunyai banyak aplikasi dalam anotasi genom, pengenalpastian penyakit dan diagnostik, menjalankan kajian ekspresi protein semasa percubaan dan pengubahsuaian protein dan kajian interaksi, dsb.

Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik
Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik

Rajah 01: Proteomik

Terdapat teknik berbeza yang terlibat dalam proteomik, termasuk pengekstrakan jumlah protein, pemisahannya menggunakan elektroforesis gel 2D, penjujukan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau spektrometri jisim dan analisis struktur dan fungsian. sifat protein menggunakan perisian berasaskan komputer dan alat bioinformatik.

Apakah Metabolomik?

Metabolomik ialah kajian tentang semua metabolit dalam sel, tisu atau organisma. Ia termasuk pengenalpastian dan kuantifikasi metabolit selular menggunakan alat analisis dan statistik lanjutan yang berbeza. Metabolomik ialah kajian penting kerana ia mendedahkan maklumat mengenai metabolisme sesuatu organisma.

Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik
Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik

Rajah 02: Metabolomik

Untuk mengkaji substrat dan produk tindak balas metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri jisim sebagai platform analisis. Spektrometri jisim menghasilkan metabolit dan kepekatannya, mencerminkan keadaan biokimia sebenar sel atau tisu. Oleh itu, metabolomik boleh dianggap sebagai perwakilan terbaik bagi fenotip molekul sesuatu organisma. Di samping itu, metabolomik boleh dianggap sebagai lanjutan daripada proteomik kerana kebanyakan metabolit dihasilkan disebabkan oleh aktiviti enzim iaitu protein.

Apakah Persamaan Antara Proteomik dan Metabolomik?

  • Proteomik dan metabolomik ialah dua sains omik yang berkaitan dengan genomik.
  • Metabolomik boleh dianggap sebagai lanjutan daripada proteomik.
  • Proteome dan metabolom berkait rapat dengan banyak kajian.

Apakah Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik?

Proteomik ialah kajian berskala besar protein termasuk struktur dan fungsinya, dalam sel atau organisma. Sementara itu, metabolomik ialah kajian profil metabolit dalam sel, tisu atau organisma di bawah satu set keadaan. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara proteomik dan metabolomik. Selain itu, proteomik terutamanya melibatkan set lengkap protein manakala metabolomik terutamanya melibatkan set lengkap metabolit, termasuk pelbagai pelbagai molekul kecil seperti peptida, karbohidrat, lipid, nukleosida, dan produk katabolik sebatian eksogen, dll. Oleh itu, ini adalah satu lagi perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Infografik di bawah meringkaskan perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik dalam Bentuk Jadual
Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik dalam Bentuk Jadual

Ringkasan – Proteomik lwn Metabolomik

Organisme hidup boleh dikaji menggunakan genom, protein dan metabolitnya. Genomik, proteomik dan metabolomik ialah tiga bidang yang mengkaji susunan genetik, protein dan metabolit sel atau organisma, masing-masing. Proteomik adalah penting kerana ia adalah pantulan dinamik kedua-dua gen dan persekitaran. Metabolomik adalah sangat penting kerana ia secara langsung mencerminkan status semasa tindak balas biokimia sel atau status metabolik organisma. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Disyorkan: