Perbezaan Utama – VNTR lwn STR
Kajian DNA mempunyai kegunaan yang besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik dan memetakan genom organisma. Beberapa teknik yang dikaitkan dengan analisis DNA digunakan untuk mengenal pasti gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenali sebagai penanda genetik. Penanda genetik digunakan dalam biologi molekul untuk mengenal pasti variasi genetik antara individu dan spesies. Ulangan tandem nombor boleh ubah (VNTR) dan ulangan tandem pendek (STR) adalah dua jenis penanda genetik yang menunjukkan polimorfisme dalam kalangan individu. Kedua-dua jenis adalah DNA berulang bukan pengekodan yang merupakan ulangan bersamaan. Mereka disusun mengikut fesyen kepala ke ekor dalam kromosom. VNTR ialah bahagian genom di mana urutan nukleotida pendek diulang beberapa kali. STR ialah satu lagi bahagian DNA dalam genom yang disusun sebagai unit berulang yang terdiri daripada dua hingga tiga belas nukleotida dalam seratus kali. Perbezaan utama antara VNTR dan STR ialah bilangan nukleotida dalam urutan berulang. Unit berulang VNTR terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida manakala unit berulang STR terdiri daripada 2 hingga 13 nukleotida. VNTR dan STR digunakan secara meluas dalam kajian forensik.
Apakah itu VNTR?
Ulangan tandem ialah urutan pendek DNA yang diulang dalam fesyen kepala ke ekor pada lokus kromosom tertentu. Tiada jujukan atau nukleotida lain dalam ulangan tandem. Terdapat beberapa jenis ulangan tandem dalam genom. VNTR ialah sejenis ulangan tandem antaranya yang mempunyai unit berulang yang terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida. VNTR ialah sejenis satelit mini. Ulangan tandem ini boleh didapati dalam banyak kromosom. Mereka berselang-seli dalam genom manusia dan terletak terutamanya di kawasan subtelomerik kromosom.
VNTR menunjukkan polimorfisme ulangan serentak dalam kalangan individu. Panjang VNTR di lokasi tertentu kromosom sangat berubah-ubah di kalangan individu disebabkan oleh variasi dalam bilangan unit berulang yang dianjurkan dalam bahagian DNA tersebut. Oleh itu, VNTR boleh digunakan sebagai alat yang berkuasa dalam mengenal pasti individu dan analisis VNTR digunakan dalam banyak bidang termasuk genetik, penyelidikan biologi, forensik dan pencetakan jari DNA. VNTR adalah penanda genetik pertama yang digunakan untuk mengukur engraftment pemindahan sumsum tulang. VNTR juga merupakan penanda polimorfik pertama yang digunakan dalam pemprofilan DNA dalam forensik.
Rajah 01: Variasi VNTR dalam enam individu
Analisis VNTR dilakukan melalui polimorfisme panjang serpihan sekatan diikuti oleh hibridisasi selatan. Oleh itu, ia memerlukan sampel DNA yang agak besar. Tafsiran profil VNTR juga bermasalah. Disebabkan pengehadan ini, penggunaan VNTR dalam genetik forensik telah dihadkan dan ia digantikan dengan analisis STR.
Apakah itu STR?
STR ialah bahagian DNA yang sangat berulang yang terdiri daripada dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang disusun secara serentak. STR serupa dengan VNTR. Tetapi ia berbeza dari VNTR daripada bilangan nukleotida dalam urutan berulang dan bilangan ulangan. STR ialah sejenis mikrosatelit.
Analisis STR yang terlibat dalam mengukur bilangan tepat unit berulang. STR sangat berubah-ubah di kalangan individu, serupa dengan VNT. Profil STR berbeza dari seorang ke seorang. Oleh itu, analisis STR digunakan dalam biologi molekul untuk membandingkan lokus spesifik pada DNA daripada dua atau lebih sampel. Oleh itu STR dianggap sebagai penanda genetik yang kuat dalam biologi molekul. Ia menyediakan alat yang sangat baik untuk mengenal pasti individu kerana tahap polimorfisme mereka yang tinggi dan panjang yang agak pendek.
Pada masa ini, STR ialah alat polimorfisme genetik dianalisis yang paling biasa digunakan dalam genetik forensik. Kebanyakan kerja kes forensik melibatkan analisis polimorfik STR. Lokus STR tersebar di seluruh genom. Terdapat beribu-ribu STR yang terletak dalam kromosom yang boleh digunakan dalam analisis forensik. Analisis STR tidak melibatkan polimorfisme panjang sekatan seperti analisis VNTR. Analisis STR tidak memotong DNA dengan enzim sekatan. Probe khusus digunakan untuk melekatkan kawasan yang dikehendaki pada DNA dan menggunakan teknik PCR, panjang STR ditentukan.
Rajah 02: variasi STR antara sampel
Apakah Persamaan Antara VNTR dan STR?
- VNTR dan STR ialah DNA bukan pengekodan.
- Kedua-duanya adalah ulangan serentak.
- Kedua-duanya menunjukkan polimorfisme dalam kalangan individu kerana perbezaan panjang bahagian DNA.
- Kedua-duanya digunakan sebagai penanda genetik yang berkuasa dalam cetakan jari DNA dan dalam kajian forensik.
Apakah Perbezaan Antara VNTR dan STR?
VNTR lwn STR |
|
VNTR ialah DNA berulang bukan pengekodan yang mempunyai jujukan nukleotida pendek berulang secara serentak. | STR ialah bahagian DNA yang sangat berulang yang terdiri daripada dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang disusun secara serentak. |
Saiz | |
VNTR lebih besar daripada STR. | STR adalah lebih kecil daripada VNTR. |
Bilangan Nukleotida dalam Urutan Berulang | |
Unit berulang VNTR terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida. | Unit berulang STR terdiri daripada 2 hingga 13 nukleotida. |
Ringkasan – VNTR lwn STR
VNTR dan STR ialah dua penanda genetik berkuasa yang digunakan dalam biologi molekul, terutamanya dalam bidang genetik forensik. VNTR ialah sejenis satelit mini dan STR ialah mikrosatelit. VNTR dan STR adalah bukan pengekodan, DNA yang sangat berulang. Mereka berulang secara tandem. Struktur umum VNTR dan STR adalah sama. Walau bagaimanapun, bilangan nukleotida dalam urutan berulang dan panjang adalah berbeza. VNTR mempunyai urutan berulang terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida. STR mempunyai urutan berulang yang terdiri daripada 2 hingga 13 nukleotida. Ini adalah perbezaan antara VNTR dan STR.
Muat turun Versi PDF VNTR vs STR
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian mengikut nota petikan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara VNTR dan STR.