Perbezaan Utama – Genotaip lwn Penjujukan
Genotaip dan penjujukan ialah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan maklumat tentang asid nukleik, terutamanya DNA sesuatu organisma. Perbezaan utama antara genotaip dan penjujukan ialah genotaip ialah proses menentukan varian genetik yang individu miliki menggunakan penanda manakala penjujukan ialah penentuan urutan nukleotida yang betul dalam serpihan DNA yang diberikan.
Apakah Genotaip?
Genotyping ialah penentuan susunan genetik individu menggunakan urutan DNA dan penanda serta perbandingan dan pengenalpastian warisannya. Genotaip adalah penting dalam biologi evolusi, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetik organisma. Ia boleh dilakukan dengan teknik yang berbeza termasuk penjujukan DNA, tindak balas rantai polimerase, polimorfisme panjang serpihan sekatan (RFLP), pengesanan polimorfik diperkuat secara rawak, polimorfisme panjang serpihan diperkuat (AFLP), susunan mikro DNA, dsb.
Genotyping melibatkan penjujukan serpihan kecil tertentu bagi jujukan DNA dan mencari perkaitan komposisi genetik dengan individu lain menggunakan penanda genetik. Ia menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di kalangan individu atau alel tertentu. Genotaip boleh digunakan untuk pelbagai organisma termasuk manusia. Ia juga boleh digunakan untuk mikroorganisma seperti virus, kulat dsb. dan boleh digunakan untuk menentukan varian genetiknya dengan profil rujukan. Dalam epidemiologi molekul dan mikrobiologi forensik, kawalan patogen, terutamanya mikroorganisma, dilakukan oleh maklumat yang diperoleh daripada genotaip. Genotaip sangat penting dalam analisis keturunan. Manusia adalah genotip untuk mengesahkan keibuan dan kebapaan. Genotip akan mendedahkan alel dominan dan resesif gen yang menentukan sifat tertentu.
Rajah_1: Genotaip RFLP
Apakah itu Penjujukan?
Penjujukan ialah proses menentukan susunan nukleotida yang betul dalam serpihan DNA atau RNA tertentu. Hampir semua maklumat yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan organisma dikodkan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk menghasilkan dan memisahkan beberapa ratus nukleotida serpihan asid nukleik panjang membawa kepada pembangunan prosedur untuk menentukan jujukan nukleotida yang tepat bagi serpihan DNA atau RNA tertentu. Pelbagai jenis kaedah penjujukan tersedia hari ini. Kaedah penjujukan ini, bersama-sama dengan teknologi untuk pembinaan perpustakaan genom yang mewakili keseluruhan genom organisma, memudahkan penjujukan keseluruhan genom organisma itu, membuat analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, kawasan kawal selia gen dll.
Jumlah genom bagi banyak virus, beberapa bakteria, archaebacteria, yis dan beberapa organisma lain telah disusun dan dipetakan. Projek genom manusia telah memungkinkan untuk menyusun dan memetakan keseluruhan genom manusia dan menerbitkan draf pertamanya pada tahun 2003. Ia merupakan peristiwa penting dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia kini digunakan dalam sektor perubatan untuk mengenal pasti punca genetik penyakit jarang berlaku, menyaring risiko penyakit pada bayi baru lahir, mengenal pasti butiran genetik kanser yang berbeza, membangunkan terapeutik baharu dan membangunkan alat diagnostik baharu, dsb.
Dalam dunia tumbuhan, genom padi dan genom Arabidopsis telah dijujukan. Pengetahuan tentang jujukan ini sudah pasti akan merevolusikan pemahaman kita tentang cara sel dan organisma berfungsi.
Rajah_2: Autoradiograf penjujukan sanger
Apakah perbezaan antara Genotaip dan Penjujukan?
Genotyping vs Sequencing |
|
| Genotyping ialah proses menentukan komposisi genetik individu dan menyemak kumpulan atau taksonomi organisma tersebut. | Penjujukan ialah proses menentukan susunan nukleotida yang tepat bagi serpihan DNA atau RNA tertentu. |
| Teknik | |
| RFLP, Penjujukan gen, PCR, susunan mikro DNA, AFLP dll. | Penjujukan Sanger, penjujukan Gilbert, Pyrosequencing, Penjujukan Generasi Seterusnya, Penjujukan senapang patah dsb. |
| Kebimbangan Utama | |
| Ini lebih membimbangkan sama ada perbezaan genotip memberikan perbezaan fenotip sebenar. | Ini lebih mementingkan susunan nukleotida dan perbezaan serta perubahannya dengan organisma lain. |
Ringkasan – Genotaip lwn Penjujukan
Genotaip dan penjujukan berguna untuk mengkaji maklumat genetik organisma. Genotaip ialah proses menentukan variasi genotip di kalangan individu dan mencari kategori mereka. Penjujukan ialah proses menentukan susunan nukleotida yang betul dalam serpihan yang berminat atau rantau DNA. Kedua-dua teknik memberikan maklumat penting tentang gen dan genom.
