Transposon lwn Retrotransposon
Transposon dan retrotransposon ialah komponen genetik DNA, dan terdapat perbezaan besar antara mereka. Peratusan kehadiran bahan genetik ini berbeza mengikut spesies, dan fungsinya menentukan nasib organisma dengan mutasi dan perubahan fenotip penting yang lain. Transposon dan retrotransposon ialah gen atau koleksi gen tertentu yang terletak dalam helai DNA, dan perubahan lokasinya telah menjadi punca utama akibat ini. Walau bagaimanapun, artikel ini berhasrat untuk membincangkan fungsi gen ini secara ringkas dan membentangkan perbandingan antara transposon dan retrotransposon.
Apakah itu Transposon?
Transposon ialah serpihan atau segmen DNA yang menarik dengan keupayaan untuk menukar lokasi untaian DNA dalam bentuk mekanisme potong dan tampal. Kerana sifat mudah alih transposon ini, ini dikenali sebagai gen melompat. Transposon terdiri daripada dua jenis utama yang dikenali sebagai Transposon Kelas I dan Transposon Kelas II. Biasanya, jenis Kelas II dirujuk sebagai transposon dan jenis Kelas I dirujuk sebagai retrotransposon. Proses memotong dan menampal segmen DNA mudah alih dikawal oleh enzim transposase. Enzim mengikat kedua-dua hujung transposon dan memotong ikatan fosfodiester untaian DNA, mengasingkan transposon, memindahkannya ke tapak sasaran, dan mengikat di lokasi baharu. Walau bagaimanapun, proses ini menarik untuk difahami, kerana sesetengah transposon hanya boleh bergerak ke lokasi tertentu sahaja kerana ketidakserasian jujukan asas dengan tapak sasaran. Gen dengan satu hujung untai tunggal mempunyai urutan asas yang sama dengan hujung satu lagi untai tunggal adalah transposon dengan tepi melekit, kerana gen tersebut boleh mengikat tapak untaian DNA sasaran dengan urutan asas yang sama seperti pada hujung melekit.. Walau bagaimanapun, mobiliti gen ini boleh menyebabkan perubahan genotip dan juga dalam fenotip organisma. Para saintis mencipta tentang transposon dan makanan dan organisma yang diubah suai secara genetik mengikut penyesuaian pilihan kemudiannya disediakan. Tanaman pertanian yang sangat produktif, antibiotik dengan sifat perubatan, haiwan ternakan adalah beberapa produk yang dibangunkan secara berfaedah selepas penciptaan transposon oleh Barbara McClintock pada tahun 1940-an.
Apakah itu Retrotransposon?
Retrotransposon ialah transposon Kelas I, dan ini bergerak melalui genom melalui mekanisme salin dan tampal. Mekanisme mobiliti retrotransposon melibatkan beberapa langkah utama seperti penyalinan segmen gen untaian DNA ke dalam RNA, pemindahan salinan RNA ke tapak sasaran, transkripsi urutan RNA kembali ke DNA menggunakan transkripase terbalik, dan penyisipan. gen ke lokasi baru untai DNA genom. Kedua-dua hujung retrotransposon ini biasanya mempunyai ulangan terminal yang panjang dengan kira-kira 1000 pasangan asas, dan ia digunakan sebagai ciri pengenalan gen ini. Gen-gen ini mudah diperkuatkan di dalam genom, dan peratusan retrotransposon dalam genom manusia adalah kira-kira 50%. Ini mungkin agak berbahaya kerana virus penyebab AIDS, HIV, dan virus leukemia sel T mempunyai retrotransposon dalam genom RNA mereka. Malah, virus ini boleh mengikat retrotransposon ke mana-mana tapak helai DNA manusia dengan menggunakan transkripase terbalik dan integrase. Enzim integrase berfungsi dengan cara yang sama seperti transposase dalam transposon Kelas II.
Apakah perbezaan antara Transposon dan Retrotransposon?
• Transposon ialah gen lompat Kelas II manakala retrotransposon termasuk dalam kategori Kelas I.
• Transposon berfungsi dengan enzim transposase manakala retrotransposon berfungsi dengan menggunakan dua enzim utama yang dikenali sebagai reverse transcriptase dan integrase.
• Hujung terminal lebih lama dalam retrotransposon berbanding transposon.
• Transposon dipotong dari asal dan ditampal pada sasaran; sebaliknya, retrotransposon disalin daripada asal ke dalam RNA dan ditranskripsikan pada sasaran.
• Pergerakan retrotransposon melibatkan RNA tetapi tidak dalam transposon.