Perbezaan utama antara crRNA tracrRNA dan gRNA ialah crRNA ialah salah satu daripada dua jenis RNA CRISPR, yang merupakan pelengkap kepada urutan DNA sasaran, manakala tracrRNA ialah jenis RNA kedua CRISPR, yang berfungsi sebagai perancah pengikat untuk nuklease Cas dan gRNA ialah salah satu daripada dua komponen utama sistem CRISPR-Cas9 bakteria dan archaea yang mengiktiraf DNA sasaran dan membimbing protein Cas untuk membuat pecahan dua helai dalam DNA sasaran.
CRISPR ialah singkatan kepada ulangan palindromik pendek berselang biasa berkelompok. Ia adalah salah satu sistem imun dalam bakteria dan archaea. Bakteria dan archaea menggunakan sistem ini untuk melindungi diri mereka daripada patogen virus. Ia adalah salah satu mekanisme paling menakjubkan yang melibatkan pengubahsuaian genetik yang berjaya. Mekanisme ini (CRISPR-Cas9) digunakan sebagai alat penyuntingan gen baru dalam Bioteknologi. Ia telah membawa kemajuan baharu kepada bioteknologi, terutamanya dalam bidang kejuruteraan genetik.
Terdapat dua komponen utama sistem CRISPR-Cas9. Mereka adalah nuklease RNA (gRNA) dan CRISPR-associated (Cas). RNA panduan ialah jujukan RNA khusus yang membimbing protein Cas untuk membelah DNA sasaran. RNA panduan terdiri daripada dua jenis RNA. Mereka adalah RNA crispr (crRNA) dan tracrRNA. Nuklease berkaitan CRISPR (Cas) ialah endonuklease bukan spesifik yang membuat pemisahan rantai dua dalam DNA sasaran. Dengan membuat pemecahan rantai ganda dalam DNA sasaran, bakteria dan archaea mengarahkan mekanisme pembaikan endogen mereka untuk menyahaktifkan DNA virus.
Apakah itu crRNA?
crRNA atau RNA Crispr ialah salah satu daripada dua jenis RNA panduan. Secara struktur, ia adalah jujukan nukleotida 17-20. Ciri crRNA yang paling berharga ialah ia adalah pelengkap kepada DNA sasaran. Oleh itu, crRNA sepadan dengan urutan DNA virus. Kekhususan sistem CRISPR-Cas 9 bergantung pada crRNA. Dalam bakteria, crRNA wujud bersatu dengan jujukan tracrRNA, yang merupakan jenis kedua RNA CRISPR. Pengeluaran crRNA dicetuskan oleh pendedahan semula bakteria kepada virus. Apabila terdedah, transkripsi gen yang mengekodkan crRNA berlaku. Kemudian, mekanisme pertahanan bermula terhadap virus.
Rajah 01: Sistem CRISPR-Cas9
Apakah itu tracrRNA?
crRNA pengaktifan trans atau tracrRNA ialah bahagian kedua guideRNA atau RNA CRISPR. Ia disebut sebagai RNA pengesan. tracrRNA berfungsi sebagai perancah pengikat untuk protein endonuclease Cas 9. Dalam erti kata lain, tracrRNA berfungsi sebagai pemegang untuk membimbing Cas9 ke arah DNA sasaran. Secara struktur, tracrRNA mempunyai 42 nukleotida. Ia wujud digabungkan dengan crRNA.
Apakah itu gRNA?
Panduan RNA atau gRNA ialah salah satu daripada dua komponen utama sistem imun CRISPR-Cas9. Ia adalah jujukan RNA khusus yang terdiri daripada dua unsur: crRNA dan tracrRNA. gRNA mengiktiraf DNA sasaran dan mengarahkan protein Cas untuk membuat pemisahan dua helai dalam DNA sasaran. Untuk melakukannya, crRNA terdiri daripada urutan pelengkap DNA sasaran manakala tracrRNA membimbing protein Cas yang berfungsi sebagai pemegang.
Rajah 02: gRNA
Mereka bentuk gRNA yang betul ialah langkah kritikal dalam alat pengeditan gen CRISPR-Cas9. Oleh itu, kejayaan dan kecekapan penyuntingan sistem CRISPR bergantung pada jujukan gRNA yang betul. gRNA boleh dinyatakan dalam sel daripada plasmid yang ditransfeksi. Apabila plasmid klon dimasukkan ke dalam sel, sel perumah menjana gRNA. GRNA yang paling biasa dihasilkan terdiri daripada 100 pasangan asas.
Apakah Persamaan Antara crRNA tracrRNA dan gRNA?
- crRNA, tracrRNA dan gRNA ialah jujukan RNA yang terdapat dalam bakteria dan arkea.
- Semuanya tergolong dalam sistem CRISPR.
- gRNA diperbuat daripada crRNA dan tracrRNA.
- Mereka terlibat dalam mengenali DNA bakteriofaj dan membimbing endonuklease ke arah DNA sasaran.
- Oleh itu, ketiga-tiga jenis RNA terlibat dalam mengarahkan nuklease Cas9 untuk membuat pemecahan rantai ganda dalam bahan genetik asing yang menyerang.
- Kejayaan percubaan CRISPR bergantung pada ketiga-tiga jenis RNA.
Apakah Perbezaan Antara crRNA tracrRNA dan gRNA?
crRNA ialah sebahagian daripada gRNA CRISPR yang merupakan pelengkap kepada DNA sasaran, manakala tracrRNA ialah bahagian kedua gRNA, yang berfungsi sebagai perancah pengikat untuk nuklease Cas.gRNA ialah gabungan crRNA dan tracrRNA, dan ia merupakan salah satu daripada dua komponen sistem CRISPR-Cas9, yang mengiktiraf DNA sasaran dan membimbing nuklease untuk membuat pemisahan dua helai dalam DNA sasaran. Jadi, ini ialah perbezaan utama antara crRNA tracrRNA dan gRNA.
Jadual berikut meringkaskan perbezaan antara crRNA tracrRNA dan gRNA.
Ringkasan – crRNA lwn tracrRNA lwn gRNA
Sistem CRISPR-Cas9 ialah sistem imun bakteria dan archaea. Sistem ini digunakan sebagai alat penyunting gen dalam Bioteknologi. CRISPR terdiri daripada dua jenis RNA iaitu CRISPR RNA (crRNA) dan transactivating CRISPR RNA (tracrRNA). Mereka secara kolektif dikenali sebagai guideRNA atau gRNA. RNA ini mengiktiraf urutan sasaran patogen penceroboh dan membimbing endonuklease untuk membuat pemisahan dua helai dalam DNA sasaran. Sebaik sahaja pemecahan dua helai dibuat dalam bahan genetik asing, mekanisme pembaikan endogen (nonhomologous end joining; NHEJ) menyahaktifkan DNA asing dengan memperkenalkan mutasi. Oleh itu, ini meringkaskan perbezaan antara crRNA tracrRNA dan gRNA.
