Perbezaan utama antara CRISPR dan CRISPR Cas9 ialah CRISPR (berkelompok berulangan palindromik pendek bersilang secara teratur) ialah mekanisme pertahanan imun prokariotik yang berlaku secara semula jadi manakala CRISPR cas9 ialah nuklease Cas9 dipandu RNA yang merupakan sebahagian daripada penyesuaian CRISPR sistem imun.
CRISPR ialah sistem imun pertahanan antivirus yang terdapat dalam bakteria dan archaea. Ia adalah keluarga urutan DNA yang terdapat dalam genom bakteria. Ia terdiri daripada jujukan spacer yang berasal daripada serpihan DNA bakteriofaj yang telah menjangkitinya sebelum ini. Dalam jangkitan virus berikutnya, bakteria menggunakan urutan ini untuk memusnahkan DNA virus. Urutan CRISPR mempunyai ulangan palindromik pendek dan jujukan spacer. Lebih-lebih lagi, urutan spacer ulangan CRISPR selalunya mempunyai gen yang berkaitan dengan kod untuk protein Cas. Cas9 ialah endonuklease berpandu RNA. Bersama-sama dengan jujukan CRISPR, protein Cas9 bertindak sebagai sistem imun adaptif dalam bakteria terhadap bakteriofaj.
Apakah itu CRISPR?
CRISPR bermaksud Ulangan Palindromik Pendek Berkelompok. Ia adalah sekumpulan urutan DNA yang terdapat dalam genom bakteria. Ia berfungsi sebagai mekanisme pertahanan semula jadi dalam bakteria, dan ia mula dikenal pasti dalam E. coli. Dalam bakteria, ia bertindak sebagai perlindungan imun adaptif, terutamanya terhadap bacteriophages. Oleh itu, ia adalah mekanisme khusus urutan.
Rajah 01: CRISPR
Sistem CRISPR mengandungi beberapa urutan ulangan DNA bersegmen pendek. Ulangan ini adalah palindromik, mempunyai urutan asas yang sama apabila membaca dari 5' hingga 3' manakala satu lagi memberikan urutan yang sama apabila membaca dari 3' hingga 5'. Lebih-lebih lagi, ulangan adalah sama. Ia terletak di antara jujukan DNA "spacer" pendek yang tidak sama. Tetapi jujukan DNA spacer ini serupa atau sepadan dengan DNA bakteriofaj asing. Gen yang dikaitkan dengan CRISPR dikenali sebagai gen berkaitan CRISPR atau gen Cas. Kod gen Cas untuk protein Cas yang merupakan helikas atau nuklease. Helikas melepaskan DNA manakala nuklease memotong DNA. Secara keseluruhan, apabila mempertimbangkan CRISPR, ia adalah sistem imun bakteria yang bertindak melawan bakteria (bakteria yang menjangkiti virus).
Apakah itu CRISPR Cas9?
Cas9 atau protein berkaitan CRISPR 9 ialah endonuklease berpandukan RNA bakteria. Oleh itu, ia adalah enzim yang mengiktiraf dan memotong DNA sasaran (terutamanya DNA bakteriofaj) pelengkap kepada RNA panduan. Ia menjalankan belahan khusus helai. Protein Cas9 dikodkan oleh gen berkaitan CRISPR. CRISPR cas9 ialah sistem nuklease CRISPR-Cas9 berpandukan RNA yang boleh digunakan sebagai platform penyasaran dan penyuntingan DNA boleh diprogramkan RNA untuk penyuntingan genom, gangguan transkrip, modulasi epigenetik dan pengimejan genom. Sistem cas9 CRISPR ini sangat popular dalam sistem penyuntingan genom semasa.
Rajah 02: CRISPR Cas9
Pada masa ini, sistem CRISPR/Cas9 digunakan untuk mengubah atau mengubah suai genom mamalia sama ada melalui penindasan atau pengaktifan transkripsi. Sel-sel mamalia boleh bertindak balas terhadap pemecahan DNA pengantara CRISPR/Cas9 dengan menggunakan mekanisme pembaikan. Ia boleh dilakukan sama ada menggunakan kaedah penyambungan hujung bukan homolog (NHEJ) atau pembaikan terarah homologi (HDR). Kedua-dua mekanisme pembaikan ini berlaku dengan memperkenalkan rehat bertali dua. Ini mengakibatkan penyuntingan gen mamalia. NHEJ boleh membawa kepada ablasi mutasi gen dan boleh digunakan untuk mencipta kehilangan kesan fungsi. HDR boleh digunakan untuk memperkenalkan mutasi titik tertentu atau memperkenalkan segmen DNA dengan panjang yang berbeza-beza. Pada masa ini, sistem CRISPR/ Cas digunakan dalam bidang terapeutik, bioperubatan, pertanian dan aplikasi penyelidikan.
Apakah Persamaan Antara CRISPR dan CRISPR Cas9?
- Cas9 ialah sebahagian daripada sistem CRISPR Cas.
- Sistem Crisper cas9 ialah sistem imun yang secara semula jadi ditemui dalam bakteria.
Apakah Perbezaan Antara CRISPR dan CRISPR Cas9?
CRISPR ialah sekumpulan jujukan DNA yang terdapat dalam genom bakteria yang berfungsi sebagai sistem pertahanan semula jadi terhadap bakteriofaj. Ia terdiri daripada ulangan palindromik pendek yang bersilang secara kerap, pengatur jarak dan gen yang berkaitan. Sebaliknya, cas9 ialah protein berkaitan CRISPR 9, yang merupakan enzim endonuklease berpandu RNA. Ia mengenali dan membelah DNA untai ganda virus. Malah, ia adalah sebahagian daripada sistem pertahanan CRISPR. Jadi, ini ialah perbezaan utama antara CRISPR dan CRISPR cas9.
Ringkasan – CRISPR lwn CRISPR Cas9
CRISPR Sistem Cas ialah sistem pertahanan mikrob. CRISPR ialah sekumpulan jujukan DNA yang terdiri daripada ulangan pendek palindromik, jujukan spacer dan gen yang berkaitan. Cas9 ialah satu protein Cas yang merupakan endonuklease berpandu RNA. Protein CRISPR dan Cas9 menjadikan sistem imun yang berfungsi melawan jangkitan bakteriofaj dalam bakteria. Protein Cas9 mampu membelah DNA virus asing dan mengganggunya. CrRNA membimbing cas9 untuk mengenali DNA virus. Oleh itu, sistem CRISPR cas9 ialah sistem imun semula jadi yang terdapat dalam bakteria melawan virus. Oleh itu, ini adalah ringkasan perbezaan antara CRISPR dan CRISPR cas9.
