Perbezaan utama antara PCR konsensus dan PCR pan ialah PCR konsensus sentiasa menyasarkan kawasan yang dipelihara manakala Pan PCR menyasarkan kawasan berubah-ubah untuk mengenal pasti strain yang berbeza bagi sesuatu kumpulan
Tindak balas rantai polimerase (PCR) ialah teknik penguatan gen yang terdiri daripada tiga langkah utama sebagai denaturasi, penyepuhlindapan dan lanjutan. Ini digunakan secara meluas dalam diagnostik dan pengenalpastian molekul. Teknik PCR dan Pan PCR konsensus adalah berdasarkan sasaran primer yang digunakan oleh setiap jenis PCR.
Apakah itu PCR Konsensus?
Consensus PCR ialah teknik PCR yang menyasarkan kawasan yang dipelihara untuk spesies atau genera tertentu. Oleh itu, kawasan yang sangat terpelihara dipilih untuk penguatan. Melalui kaedah ini, organisma boleh dikenal pasti dan dibezakan berdasarkan konsensus mereka. Kaedah ini mengenal pasti kawasan terpelihara untuk spesies tertentu. Sebagai contoh, kawasan rRNA 16s bakteria kekal sebagai kawasan terpelihara di kalangan bakteria. Oleh itu, hanya satu set primer diperlukan untuk amplifikasi. Dalam kebanyakan keadaan, buku asas universal yang khusus boleh digunakan untuk kawasan yang dipelihara.
Rajah 01: Teknik PCR
Dengan mengikuti kaedah PCR konsensus, pencirian spesies dan hubungan evolusi boleh disimpulkan. Berdasarkan kecekapan amplifikasi organisma sampel tertentu, konsensus organisma terhadap kumpulan juga boleh disimpulkan. Selanjutnya, menjalankan PCR konsensus adalah penting dalam kajian filogenetik. Ia membenarkan pengecaman spesies dan mentafsirkan sisihan organisma tertentu yang ditunjukkan dari segi nenek moyang yang sama.
Apakah Pan PCR?
A Pan PCR ialah mod pemultipleksan PCR. Dalam teknik ini, strain yang berbeza dikuatkan menggunakan pelbagai sasaran primer. Sasaran, bagaimanapun, boleh menjadi sasaran biasa untuk kumpulan terikan. Oleh itu, dalam Pan PCR, lebih daripada dua set primer boleh digunakan pada satu masa. Ia boleh berlaku dalam kaedah tindak balas tiub tunggal atau sebagai kaedah tindak balas berbilang tiub. Pan PCR lebih memakan masa dan lebih kompleks berbanding PCR konsensus. Atas sebab ini, tafsiran keputusan PCR juga mungkin lebih kompleks dalam Pan PCR.
Aplikasi utama Pan PCR adalah dalam diagnostik molekul. Ia membolehkan membezakan antara strain berlainan spesies dengan amplifikasi sasaran. Pan PCR ialah teknik yang ideal untuk mengenal pasti strain berbeza bagi satu spesies yang menyebabkan penyakit. Dalam kebanyakan keadaan, automasi teknik Pan PCR untuk pelbagai keadaan kesihatan adalah sangat penting dan merupakan teknik yang boleh dipercayai dan sangat cekap.
Apakah Persamaan Antara PCR Konsensus dan Pan PCR?
- Consensus PCR dan Pan PCR ialah dua jenis teknik PCR.
- Kedua-dua prosedur mengikut prosedur umum tiga langkah – denaturasi, penyepuhlindapan dan lanjutan.
- Mereka menggunakan primer yang khusus sasaran.
- Kedua-dua tindak balas berlaku dalam kitar haba.
- Tindak balas ini boleh diautomasikan.
- Kedua-duanya boleh digunakan dalam diagnostik dan pengenalpastian molekul; namun, ketepatannya berbeza-beza.
- Prosedur ini memerlukan pengesahan.
Apakah Perbezaan Antara PCR Konsensus dan Pan PCR?
Kedua-dua Konsensus dan Pan PCR mengikut prosedur rutin yang sama. Walau bagaimanapun, perbezaan utama antara PCR konsensus dan Pan PCR adalah berdasarkan sasaran primer yang digunakan oleh setiap prosedur. Walaupun PCR konsensus sentiasa menyasarkan kawasan yang dipelihara, Pan PCR menyasarkan kawasan berubah-ubah untuk mengenal pasti strain yang berbeza bagi sesuatu kumpulan. Disebabkan perbezaan ini, protokol reka bentuk primer, bilangan set primer yang digunakan dan aplikasi khusus berbeza-beza.
Maklumat di bawah meringkaskan perbezaan antara Consensus PCR dan Pan PCR.
Ringkasan – PCR Konsensus lwn Pan PCR
PCR, yang diperkenalkan oleh Mulli, memainkan peranan revolusioner yang penting dalam aplikasi biologi molekul. Consensus dan Pan PCR ialah dua jenis PCR berdasarkan kawasan sasaran primernya. Walaupun PCR konsensus menyasarkan kawasan yang dipelihara, Pan PCR menyasarkan kawasan berubah-ubah dan memainkan peranan penting dalam pengenalpastian terikan. Disebabkan perbezaan asas ini antara PCR konsensus dan Pan PCR, fungsi khusus setiap jenis PCR juga berbeza daripada analisis filogenetik kepada pencirian molekul kepada diagnostik molekul.
