Perbezaan utama antara ITS1 dan ITS2 ialah ITS1 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 18S dan 5.8S dalam eukariota, manakala ITS2 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 5.8S dan 28S dalam eukariota.
Interna transcribe spacer (ITS) ialah DNA spacer yang biasanya terletak di antara RNA ribosom subunit kecil dan gen RNA ribosom subunit besar dalam kromosom atau dalam kawasan transkripsi yang sepadan dalam molekul transkrip prekursor rRNA polycistronic. Dalam bakteria dan archaea, hanya terdapat satu ITS antara gen rRNA 16S dan 23S. Tetapi dalam eukariota, terdapat dua DNA spacer ITS: ITS1 (antara 18S dan 5.gen 8S rRNA) dan ITS2 (antara 5.8S dan 28S rRNA). Oleh itu, ITS1 dan ITS2 ialah dua DNA spacer yang terdapat di antara gen rRNA dalam eukariota.
Apakah ITS1?
ITS1 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 18S dan 5.8S dalam eukariota. ITS merujuk kepada sekeping DNA spacer tidak berfungsi yang terletak di antara gen rRNA. ITS1 mempunyai variasi panjang yang lebih besar daripada ITS2. Variasi panjang ITS1 adalah lebih kurang (200-300bp). Penanda ITS seperti ITS1 telah membuktikan kecekapannya dalam menjelaskan hubungan filogenetik di kalangan taksa yang berbeza. Selain itu, DNA spacer ITS1 kurang dipelihara daripada DNA spacer ITS2. Struktur ITS1 hanya dipelihara dalam unit taksonomi yang lebih kecil. Setiap gugusan ribosom eukariotik juga mengandungi kawasan yang dipanggil spacer transkripsi luaran (5’ dan 3’ ETS).
Rajah 01: Wilayah ITS1
DNA pengatur jarak ITS1 sangat hampir dengan 5’pengatur transkripsi luaran (5’ ETS). Tambahan pula, jika sesiapa ingin menguatkan rantau ITS1 untuk kajian hubungan filogenetik, mereka perlu menggunakan pasangan primer tertentu (primer terbalik dan hadapan) untuk tujuan ini. Untuk menguatkan rantau ITS1, dua set primer biasanya digunakan dalam protokol PCR makmal. Ia adalah ITS1 ke hadapan dan ITS2 terbalik atau ITS1 ke hadapan dan ITS4 terbalik.
Apakah ITS2?
ITS2 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 5.8S dan 28S dalam eukariota. Rantau ITS2 mempunyai variasi panjang yang lebih pendek daripada rantau ITS1. Variasi panjang ITS2 adalah lebih kurang (180-240bp). Walau bagaimanapun, rantau ITS2 lebih terpelihara daripada rantau ITS1 dalam banyak unit taksonomi. Ia mengenal pasti bahawa semua jujukan ITS2 berkongsi teras biasa struktur sekunder. Selain itu, 40% rantau ITS2 dipelihara di kalangan semua angiosperma, sementara adalah mungkin untuk menyelaraskan 50% daripada rantau ITS2 merentas keluarga dan tahap yang lebih tinggi.
Rajah 02: Wilayah ITS2
Tidak kira skop pemuliharaan, penggunaan wilayah ITS2 juga sangat popular seperti rantau ITS1 dalam kajian hubungan filogenetik, terutamanya dalam pengekodan DNA kulat. Untuk menguatkan rantau ITS2, set primer khusus biasanya digunakan dalam protokol PCR makmal. Iaitu ITS1 foward dan ITS4 songsang. Tetapi apabila protokol PCR menggunakan set primer ini, ia juga menguatkan rantau ITS1 bersama-sama dengan rantau ITS2. Selanjutnya, DNA spacer ITS2 sangat hampir dengan spacer transkripsi luaran 3'(3' ETS).
Persamaan Antara ITS1 dan ITS2
- ITS1 dan ITS2 ialah dua DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA.
- Ia hanya terdapat dalam eukariota.
- Kedua-duanya boleh dikuatkan dengan menggunakan pasangan primer tertentu.
- Kedua-duanya dipotong dalam pematangan rRNA sebagai produk sampingan yang tidak berfungsi.
- Kedua-duanya sangat penting untuk kajian hubungan filogenetik, terutamanya dalam pengekodan DNA kulat.
Perbezaan Antara ITS1 dan ITS2
ITS1 ialah DNA spacer yang terdapat di antara gen rRNA 18S dan 5.8S dalam eukariota manakala ITS2 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 5.8S dan 28S dalam eukariota. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara ITS1 dan ITS2. Tambahan pula, ITS1 mempunyai variasi panjang yang lebih besar berbanding dengan ITS2. Sebaliknya, ITS2 mempunyai variasi panjang yang lebih pendek berbanding dengan ITS1. Ini adalah satu lagi perbezaan antara ITS1 dan ITS2.
Maklumat di bawah menyenaraikan perbezaan antara ITS1 dan ITS2 dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – ITS1 lwn ITS2
Rantau transkripsi dalaman (ITS) ialah sekeping DNA spacer yang tidak berfungsi yang terletak di antara gen rRNA. Dalam bakteria dan archaea, hanya terdapat satu kawasan ITS. Tetapi dalam eukariota, terdapat dua kawasan ITS: ITS1 dan ITS2. ITS1 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 18S dan 5.8S dalam eukariota, manakala ITS2 ialah DNA spacer yang terletak di antara gen rRNA 5.8S dan 28S dalam eukariota. Oleh itu, ini ialah ringkasan perbezaan antara ITS1 dan ITS2.
