Perbezaan utama antara cis dan penyambungan trans ialah penyambungan cis ialah mekanisme intramolekul yang mengeluarkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, manakala penyambungan trans ialah mekanisme antara molekul yang mengeluarkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama.
Penyambungan RNA ialah satu bentuk pemprosesan RNA sebelum sintesis protein. Dalam proses ini, transkrip RNA pra-messenger yang baru dibuat diubah menjadi RNA messenger yang matang. RNA messenger matang membantu menghasilkan molekul protein. Semasa penyambungan RNA, intron (kawasan bukan pengekodan) dikeluarkan, dan ekson (kawasan pengekodan) dicantumkan bersama untuk membuat mRNA matang. Cis dan trans splicing ialah dua jenis mekanisme penyambungan RNA.
Apakah Cis Splicing?
Cis splicing ialah mekanisme intramolekul yang mengeluarkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama. Penyambungan cis biasa memproses molekul RNA tunggal. Cis splicing ialah proses splicing tipikal pra mRNA yang dijalankan oleh spliceosomes. Dalam intron, tapak penderma (5' hujung intron), tapak cawangan (berhampiran 3' hujung intron) dan tapak penerima (3' hujung intron) adalah sangat penting untuk penyambungan. Tapak penderma splice termasuk GU jujukan invarian pada hujung 5’ intron. Tapak penerima sambatan di hujung 3’ intron mempunyai jujukan AG invarian. Hulu dari jujukan AG, terdapat kawasan yang dipanggil rantau pirimidin (saluran polipirimidin). Lebih jauh ke hulu dari saluran polypyrimidine, terdapat titik cawangan yang merangkumi nukleotida adenosin. Nukleotida ini terlibat dalam pembentukan lariat.
Rajah 01: Cis dan Trans Splicing
Spliceosomes utama ialah U1, U2, U4, U5 dan U6. Antaranya, U1 dan U2 sangat penting. Dalam splicing cis, U1 mengikat ke tapak splice 5', dan U2 mengikat pada titik cawangan berhampiran tapak splice 3'. U5/U4/U6 mengikat ekson di tapak 5’, dengan U6 mengikat U2. Kemudian, U1 dikeluarkan. U5 beralih dari ekson ke intron, dan U6 mengikat di tapak sambatan 5’. Tambahan pula, U4 juga dikeluarkan. U6/U2 memangkinkan transesterifikasi, menjadikan hujung 5’ intron ligat kepada nukleotida A pada intron. Ini mencetuskan pembentukan lariat. Dalam pembentukan lariat, U5 mengikat ekson pada tapak sambatan 3’, dan tapak 5’ dibelah. Pada fasa akhir penyambungan, U2/U5/U6 kekal terikat pada lariat, dan tapak 3’ dibelah. Di samping itu, ekson diikat menggunakan hidrolisis ATP dalam fasa ini.
Apakah Trans Splicing?
Trans splicing ialah mekanisme antara molekul yang mengeluarkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Dalam trans-splicing, tiada tapak sambatan 5' pada molekul pra mRNA untuk protein U1 untuk mengikat. Sebaliknya, RNA ketua splice (SL) bertutup disambungkan kepada jujukan dalam outron.
Rajah 02: Trans Splicing
Outron ialah rantau pra mRNA antara penutup 5’ dan tapak sambatan trans. Walau bagaimanapun, protein U2 mengikat ke tapak splice 3' biasanya. Selepas mengeluarkan outron, ekson ketua sambatan (SL) disambungkan ke ekson pertama pada pra mRNA. Tambahan pula, trans-splicing ialah mekanisme yang diperhatikan dalam mikroorganisma tertentu seperti protista kelas Kinetoplastae untuk mengekspresikan gen.
Apakah Persamaan Antara Cis dan Trans Splicing?
- Cis dan trans splicing ialah dua jenis mekanisme penyambungan RNA.
- Dalam kedua-dua mekanisme, intron dialih keluar.
- Selain itu, dalam kedua-dua mekanisme, ekson bercantum untuk membentuk mRNA matang.
- Kedua-dua mekanisme terdapat dalam eukariota.
- Mekanisme ini tiada dalam prokariot.
Apakah Perbezaan Antara Cis dan Trans Splicing?
Cis splicing ialah mekanisme intramolekul yang mengeluarkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, manakala trans-splicing ialah mekanisme intermolecular yang mengeluarkan intron atau outrons dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam RNA yang sama transkrip. Jadi, ini adalah perbezaan utama antara cis dan trans splicing. Tambahan pula, dalam splicing cis, intron dikeluarkan untuk membentuk mRNA matang. Sebaliknya, dalam trans splicing intron atau outron dikeluarkan untuk membentuk mRNA matang.
Infografik berikut menyenaraikan perbezaan antara cis dan penyambungan trans dalam bentuk jadual untuk perbandingan sebelah menyebelah.
Ringkasan – Cis lwn Trans Splicing
Penyambungan RNA ialah satu bentuk pemprosesan RNA sebelum proses sintesis protein. Cis dan trans splicing adalah dua jenis mekanisme splicing RNA yang terdapat dalam eukariota. Penyambungan Cis ialah mekanisme intramolekul yang mengeluarkan intron dan bergabung dengan ekson yang berada dalam transkrip RNA yang sama, manakala penyambungan trans ialah mekanisme antara molekul yang mengeluarkan intron atau outron dan bergabung dengan ekson yang tidak berada dalam transkrip RNA yang sama. Oleh itu, ini menyimpulkan perbincangan tentang perbezaan antara cis dan trans splicing.
